法律咨詢公司可以代理案件收取費用，但需要遵守相關法律法規。代理案件的收費應以國家發改委的行業價格指導為準，收費過高或不透明都會有相應的法律風險。
代理案件收費有幾種方式:
1.固定收費:律師與委托人協商後確定壹個固定的費用，無論案件需要多少工作量，律師都收取相同的費用。這種方法適用於工作量易於估算的情況；
2.按工作量收費:律師根據工作時間和案件復雜程度計算費用。律師通常在開始工作之前與客戶商定費率，並跟蹤他們在案件上花費的時間，以確定最終的費用；
3.按結果收費:律師可以根據案件的結果收費，比如成功解決糾紛或者獲得賠償。如果案件不成功，律師可以不收費或者只收取壹部分費用；
4.按小時收費:律師通常按小時收費。通過這種方式，律師將與客戶協商費率，並向客戶提供詳細的費用清單，記錄他們在解決案件上花費的時間和費用。
綜上所述，在代理收費案件的過程中，要尊重法定程序，保護當事人的合法權益，不得違反法律、法規等規定，確保合法、公正、透明。
法律依據:
《律師服務費管理辦法》第五條
律師事務所應當依法提供下列法律服務，實行政府指導價:
(壹)代理民事訴訟案件；
(二)代理行政訴訟案件；
(三)代理國家賠償案件；
(四)為刑事案件犯罪嫌疑人提供法律咨詢，代理申訴、控告，申請取保候審，擔任被告人的辯護人、自訴人或者被害人的訴訟代理人；
(五)代理各種訴訟案件的上訴。律師事務所提供其他法律服務的收費實行市場調節價。