子公司必須獨立核算，獨立申報納稅。？分公司不是獨立法人，可以不進行獨立核算，所得稅可以在總公司合並結算。1.企業所得稅規定子公司應單獨計算應納稅額，在註冊地繳納稅款，適用按月(或季)預繳、年終匯算清繳的規定。分公司成立後，企業所得稅征收管理執行跨地區匯總繳納企業所得稅的規定。子公司應收集、整理企業所得稅核定和備案的相關資料，並向當地主管稅務機關申報所得稅。總機構應當收集、整理分支機構的信息，並向總機構所在地的主管所得稅稅務機關申報。2.其他稅種對增值稅的影響，根據增值稅暫行條例，固定業戶應向其機構所在地主管稅務機關申報納稅；總機構和分支機構不在同壹縣(市)的，應當向各自所在地的主管稅務機關申報納稅。所以不管是設立子公司還是分支機構，都需要在機構所在地繳納增值稅。其他地方稅，如房產稅、土地使用稅等，必須在資產所在地繳納；企業在當地生產經營也要繳納個人所得稅。所以不管是設立子公司還是分公司，對項目所在地的地稅基本沒有影響。
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