財產分割協議只要是當事人意思表示，不處分他人財產，不違反法律的強制性或禁止性規定，在各方當事人簽字時生效。公證不是民事協議“生效”的必要條件，但公證後可以使民事協議更加有效。以後在法院發生糾紛時，除非有相反證據證明公證有誤，法院壹般會直接采納公證後的協議作為證據，無需質證。
雖然可以在雙方簽字時生效，但如果分居協議涉及的財產是不動產或準不動產，如房產、土地、車輛等。，產權轉移並辦理變更登記後，才發生產權變更的效力。如果分居協議生效後未及時辦理過戶登記，雖然協議生效，但產權不變，且原產權人(壹般是家裏的父母)反悔，以後不想再分，房產仍可能歸父母所有。
根據相關法律規定，依法成立的合同受法律保護。依法成立的合同僅對當事人具有法律約束力，但法律另有規定的除外。
法律依據:《中華人民共和國公證法》第十壹條。公證處根據自然人、法人或者其他組織的申請，辦理下列公證事項:
(1)合同(2)繼承(3)委托、聲明、贈與、遺囑(4)財產分割(5)招標拍賣(6)婚姻狀況、親屬關系、收養關系(7)出生、存活、死亡、身份、經歷、學歷、學位、職務、職稱、有無犯罪記錄(1)