海洋碳匯核算是指核算我國海洋各種碳匯因素及其變化的方法。碳匯因素包括海洋碳庫、二氧化碳、硫酸鹽等遺留物質，以及海洋生物通訊和水體碳運輸系統。在海洋碳匯核算中，碳匯模型參數主要由實測數據構建，定量分析海洋碳循環，計算不同海洋區域的平衡碳匯及其變化趨勢。
海洋碳匯核算主要可以通過監測和實驗研究海洋碳匯的形成和變化趨勢，實現海洋碳匯及其變化的定量分析。該方法可用於研究碳匯中海水的特性，揭示沈積物與碳匯的相互作用，檢測不同海域的碳匯平衡及變化趨勢。
海洋碳匯核算系統采用計算機軟硬件和測量記錄相結合的方法。需要考慮的因素是:首先，建立海洋碳匯核算模型，不同模型的數據采集和處理是不同的；其次，收集海洋、陸地和淡水區域物質循環和能量循環過程中所需的實測數據，並進行精細加工；第三，滿足碳匯核算模型輸出的統計、分析、量化和再分析以及圖形顯示功能。
海洋碳匯核算是壹項系統研究。全面分析我國海洋碳匯各要素和特征的變化規律，有助於我們深入了解海洋碳匯的形成和變化趨勢，及時發現問題，加強調查和管理，為改善海洋環境、實現海洋碳匯恢復提供有效的決策建議。