2.法律關系不同。特許經營鏈中特許人與受許人之間的關系是壹種契約關系。雙方通過訂立特許經營合同建立關系，通過合同明確各自的權利和義務。直營連鎖店總部與分店的關系由內部管理制度調整。
3.管理模式不同。特許經營鏈的核心是特許經營權的轉讓，特許人是轉讓方，受許人是接受方。特許經營體系是通過特許人和受許人簽訂特許經營合同而形成的。各加盟店的人事、財務關系相互獨立，特許人無權幹涉。在直營連鎖經營中，總部擁有所有分店，有權決定分店經營中的所有具體事務。分公司經理作為總部的員工，按照總部的意誌辦事。