1.皇帝進壹步控制了最高司法權。
在明代，皇帝對所有死刑和重案有最終的裁決權，各種聯審都要“由刑部擬定”，然後按目的執行。皇帝親自審理此案，任意使用刑罰。比如朱元璋說“有大牢，必當面對”，“重案更親切(審)，法部不委任”。當他成為祖先時，他下令“重罪必須重復五次。”明初，毛的嚴刑峻法和他的正規朝廷幕僚無人問津。只有成祖屠戮了建文帝的老臣，酷刑極其極端。“死了873人”，還有人被拔了牙，斷了手，斷了脖子。有用的油炸；有的人割耳割鼻，年中再割，對明朝的法制造成了極大的破壞，加速了明朝的衰落。
2、工廠衛生特勤機關幹擾司法。
工廠，指東廠、西廠、內廠，是由宦官組成的特務機關，專事“登門謀反、惡言相向、十惡不赦”等重案。魏，即錦衣衛，原來是皇帝親軍“十二衛”中最受信任的壹個。他的主要職責是負責皇帝的禮儀和安全事務。從太祖開始，金農衛既判兵，又判囚，擁有逮捕權和監禁權。其中南北鎮府司、北鎮府司專設禁軍監獄，又稱錦衣衛監獄。廠衛制度是皇權高度集中的產物，幾乎淩駕於司法機關之壹，被賦予各種司法特權。
(1)偵查權:其偵查範圍主要是涉及國家權力的重要案件，不幹涉壹般刑事案件。比如有的鄉親在密室喝酒後詛咒魏忠賢，魏福齡卻被工廠衛生特務抓住，後被處死。
(2)審判監督權:廠衛有訊問權，但無裁判權。
(3)法外處罰權:廠衛設立自己的專門法庭，任意刑訊逼供，捏造證據，刑訊逼供屢見不鮮。