1.固定證據，對砍伐的樹木進行拍照。
2.取得村裏出具的確認樹木所有權的證明。
3.與侵權人協商賠償。如果協商不成，可以提起訴訟。
4.法院請專業鑒定機構對砍伐樹木的財產進行評估，確定賠償金額。
祖墳樹木的法律保護；
1.民法典關於墓地權的規定:民法典界定了墓地權的內容，包括保護墓地內的樹木；
2.刑法中對毀墳的處罰:刑法中規定，對毀墳和非法盜掘墳墓的行為，將受到法律追究；
3.行政法規對森林保護的規定:有關林業法規和行政法規也對森林保護提出了具體要求；
4.民事責任:祖墳內樹木被砍伐，侵權人應承擔民事責任，包括賠償損失；
5.特殊情況下的政策規定:在壹些特殊情況下，比如公共利益的需要，可能會有特殊的政策規定適用。
總結壹下，祖墳裏的樹被砍伐，賠償方式包括固定證據、取得權屬證書、與侵權人協商賠償。如果協商不成，他們將走法院訴訟程序，由專業評估機構對樹木價值進行評估，確定賠償金額。
法律依據:
中華人民共和國刑法
第275條
故意毀壞公私財物，數額較大或者有其他嚴重情節的，處三年以下有期徒刑、拘役或者罰金；數額巨大或者有其他特別嚴重情節的，處三年以上七年以下有期徒刑。
中華人民共和國森林法
第三十二條
國家實行全面的天然林保護制度，嚴格限制天然林采伐，加強天然林管護能力建設，保護和恢復天然林資源，逐步提高天然林生態功能。具體辦法由國務院制定。
《中華人民共和國森林法實施條例》
第三十八條
盜伐森林或者其他林木，以立木材積計算不滿0.5立方米或者幼樹不滿20株的，由縣級以上人民政府林業主管部門責令補種盜伐株數10倍的樹木，沒收盜伐的林木或者銷售所得，並處盜伐林木價值3倍以上5倍以下的罰款。
第三十九條
盜伐森林或者其他林木的，依法賠償損失；由林業主管部門責令補種盜伐株數十倍的樹木，沒收盜伐的林木或者變賣所得，並處盜伐林木價值三倍以上十倍以下的罰款。濫伐森林或者其他林木的，由林業主管部門責令補種濫伐株數五倍的樹木，並處濫伐林木價值二至五倍的罰款。
中華人民共和國民法典
第1245條
飼養的動物造成他人損害的，動物飼養人或者管理人應當承擔侵權責任；但是，能夠證明損害是由於被侵權人的故意或者重大過失造成的，可以不承擔或者減輕責任。