合同專用章具有法律效力。根據法律規定，合同印章壹般代表合同的效力，而法人印章可以認定為法人的簽名，法人簽名也是代表合同效力的壹種形式。合同既有合同章又有法人章，不影響合同的效力。這份合同具有法律約束力。合同專用章，單位在簽訂合同時使用，可以在簽訂範圍內代表單位，單位承擔由此產生的權利和義務；公章可以代替合同專用章。至於合同章和公章的效力，其實在使用過程和司法實踐中是壹樣的，與合同、協議具有同等的法律效力。《民法典》第四百九十條當事人采用合同形式訂立合同的，當事人簽名、蓋章或者按手印時，合同成立。在簽字、蓋章或按指印之前，壹方已經履行了主要義務，另壹方接受時合同成立。法律、行政法規規定或者當事人約定應當采用書面形式訂立合同。如果當事人沒有以書面形式這樣做，但壹方已經履行了主要義務，另壹方接受，則合同成立。
法律依據:
《中華人民共和國民法典》第四百九十條當事人采用合同形式訂立合同的，當事人簽名、蓋章或者捺指印時，合同成立。在簽字、蓋章或按指印之前，壹方已經履行了主要義務，另壹方接受時合同成立。法律、行政法規規定或者當事人約定應當采用書面形式訂立合同。如果當事人沒有以書面形式這樣做，但壹方已經履行了主要義務，另壹方接受，則合同成立。
衍生問題:
協議是不是只有簽字沒按下才有效？有效，其實簽名和手印是法律上的證明依據，法律效力是壹樣的。簽訂合同時，簽字、蓋章、按手印都具有同等法律效力。所以只要是當事人的個人簽名，按不按手印都是有法律效力的。如果對方反悔，可以向法院提起訴訟，然後由專業的筆跡簽名人對簽名進行鑒定。