第壹，對汙染損害進行定性，即確定汙染損害是否由汙染引起。
當企業發生環境汙染事故或排放汙染物較多時，附近的農作物、經濟作物、畜禽、水產養殖等都會出現壹些異常現象。然而，受汙染物傷害的作物的癥狀往往與病蟲害、化肥使用過量或不足、微量元素缺乏和農藥使用不當引起的癥狀相似。家畜、家禽和魚類汙染造成的損害常與流行性鼠疫混淆，因此很難作出準確判斷。此時，應在當地環保部門的主持或指導下，會同各有關方面的專家進行認真調查、仔細監測、綜合分析，確定損害是否由企業排汙所致。
二、汙染損害責任的定性，即確定汙染損害責任是否在企業。
根據相關環境法律法規的規定，企業對以下原因造成的汙染損害不承擔責任:壹是完全由於不可抗拒的自然災害，經及時采取措施，不能避免水汙染損失的，免除責任；第二，如果汙染損失是由第三人的故意或者過失造成的，由第三人承擔責任。
如施工單位不聽勸阻或在企業不知情的情況下未經處理向水體排放或傾倒放射性固體廢物或油類、酸液、劇毒廢液；第三，汙染損失是由受害者自身責任造成的。例如，如果附近居民將汙水引入農田進行灌溉，或擅自使用工業廢渣，或故意將汙水引入養殖水域，企業可以不對這種情況造成的汙染損失承擔責任。
如果發生汙染損害賠償，有關企業必須拿出確鑿的證據，環保部門必須掌握必要的監測數據。企業不能提供確鑿證據證明對環境汙染不負責任的，應當根據自身責任承擔環境損害賠償。
三、汙染損害量化，即合理確定汙染損害的賠償數額。
壹旦確定汙染危害是由企業排放汙染物造成的或企業應負責任的，企業必須承擔汙染損害賠償責任。汙染損害賠償的具體數額壹般包括以下幾項:企業排放汙染物造成的直接經濟損失或間接經濟損失；受害者為恢復生產或者減少汙染損害所支付的費用；受害者消除汙染危害的實際費用。