軟件作品和專利的相似之處在於:申請成功可以獲得政府資助，兩者都可以作為申請國家高新技術企業的條件。軟件作品和專利的區別在於:
1，法律依據不同。軟件著作權保護按照《著作權法》和《計算機軟件保護條例》執行。專利保護是按照專利法實施的。
2、保護原理不同。軟件著作權是在軟件創作完成後自動產生的，軟件著作權登記也是自願的。專利必須向專利局申請保護。
3.保護的對象是不同的。軟件著作權申請提交的材料是源代碼和用戶操作手冊，所以軟件著作權保護的是表達，而不是想法。如果競爭對手已經徹底理解了軟件，更改代碼，重新編寫功能相同的軟件，那麽就不算侵權。而專利則是描述軟件在申請時的設計思路。壹旦授予專利，他人只要采用軟件專利的設計思想或方案，就可能構成侵權。
4.申請通過率不壹樣。軟件著作權登記通過率極高，專利申請對技術要求高，要滿足新穎性、創造性、實用性等諸多要求，申請難度大、通過率低。
5.申請中提供的信息不同。軟件著作權需要提供:申請人的身份證明、申請表、源代碼、使用說明書；專利需要提供:申請人身份證明文件、委托說明、技術交底(外觀專利提供圖片或照片)。
6.申請周期不壹樣。軟件版權申請周期短，可以加急，最快1。專利申請周期長，尤其是發明專利，往往需要1-2年才能授權發證。
7.保護期不壹樣。軟件著作權保護期為自然人生死後50年，類似於作品的著作權保護期。實用新型和外觀設計的保護期為自申請日起10年，而發明專利的保護期為20年。
8.申請費和維修費是不壹樣的。軟件版權只有前期申請費，沒有後續維護費；除了前期申請費，專利每年還需要繳納年費，到期後不繳納視為放棄專利權。每年的專利費要交多少年？
軟件可以申請專利，也可以申請軟件，專利保護價值更高，但專利申請費也高。軟產品相對來說沒有很好的專利保護。