北京大學醫學部莊輝教授、信息學院院長何新貴教授當選為2006 54 38+0-2005年中國工程院院士。同時當選的還有馮培德、唐喜燦、孫、龔誌本、李、劉長笑、劉、丁、等9位校友。中國工程院院士是我國設立的對在工程技術和管理領域做出突出貢獻的個人的最高學術稱號，是終身榮譽。
北京大學物理學院陳佳洱教授、醫學部韓啟德教授、數學科學學院溫嵐教授、中國經濟研究中心林毅夫教授當選為2001至2005年第三世界科學院院士。同時當選的還有、許紹燮、艾國祥、冼鼎昌、謝、徐誌展、史耀林等7位北大學子。至此，北京大學已有34名學生當選第三世界科學院院士，占我國院士總數的1/4。第三世界科學院院士是從第三世界國家的科學院、大學和研究機構以及發達國家的科學組織中選出的。院士們在各自的科學領域為第三世界國家的科學發展做出了突出貢獻。
許倩是北京大學的校友，2005年當選為美國國家科學院院士。他是美國僅有的八位擁有三個頭銜的科學家:美國國家科學院院士、美國國家工程院院士和美國國家醫學科學院院士。
北京大學數學科學學院教授、麻省理工學院數學系Simons講座教授田剛，2004年當選美國文理學院院士。他還被另外兩位來自中國的學者推選。這也是改革開放以來，大陸留美學生首次獲此殊榮。
徐榮蘭，北京大學物理系58屆校友，2003年當選國際宇航科學院基礎科學部院士。
李政道教授是北京大學近代物理中心的主任，也是北京大學的校友，他於2003年被教皇約翰·保羅二世任命為教皇科學院的院士。李政道教授現為中國科學院外籍院士、美國國家科學院院士、美國藝術與科學院院士、意大利林禽科學院院士、臺灣中央研究院院士。
北京大學校友侯朝煥、和金當選為國際電機與電子工程師學會院士。
楊(化學系，82屆)、李(物理系，85屆)、(物理系，81屆)、曾(84屆)、(物理系，90屆)當選為美國物理學會院士，北大校友***12。
2003年，北京大學校友、香港科技大學機械工程系主任余同熙教授當選為美國機械工程師學會院士和英國機械工程師學會院士，以表彰他對機械工程的重要貢獻。
王誌遠，北京大學82屆化學系校友，加拿大卡爾頓大學化學系教授，2003年當選加拿大化學研究所院士。
謝曉亮，北京大學第84化學系校友，2005年當選為美國生物物理學會院士。
謝曉亮(化學系，第84名)和張幼學(地質系，第82名)兩位北大校友於2005年當選為美國科學促進會(AAAS)院士。
宋飛軍，北京大學物理系第66屆校友，2005年當選為國際光電工程學會院士和SPIE。