組織結構對企業有效構建和實施內部控制至關重要，是企業建立具體內部控制制度的前提，直接影響內部控制制度的整體有效性。構建企業內控體系，首先要規劃組織架構，這是最基礎的工作。可以說，組織結構使有效的企業內部控制成為可能。企業的組織結構決定了內部控制的結構和過程，即有效的內部控制企業應該有壹個合適的組織。因此，企業在設計組織時，應該而且必須考慮到內部控制的要求，既能保證組織的高效運轉，又能做出相應的調整和變化，以適應內部控制環境的需要。企業應當依照《公司法》等相關法律法規，結合企業實際情況，建立規範的法人治理結構。同時，企業應當根據經營目標、職能分工和管理要求，明確高級管理人員、職能部門和分支機構、基層運營單位的責任和權限，並將權責分解到具體崗位。企業應當通過編制內部管理制度、員工手冊、組織機構圖、業務流程圖、崗位說明書、權限指引等，使員工了解和掌握內部組織機構和權責分配。企業的組織結構必須反映企業的目標和計劃、管理者可獲得的職能和權力以及企業所處的環境條件，同時組織必須配備適當的人員。組織結構的設計要明確誰來做什麽，誰對什麽結果負責，並消除因分工模糊而造成的執行障礙，還要提供能反映和支持企業目標的決策和溝通網絡。
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