對於允許堂兄妹結婚，壹些法律專家提出，這是讓婚姻更加人性化的壹項措施。但對此持反對意見的人提出了科學依據，因為大量的遺傳學和生物醫學的研究結果早就表明，近親結婚，包括表兄弟，確實不利於後代的生長發育，比如智力低下。首先，由於很多表親提出了實質性的問題，禁止表親結婚是違背婚姻自由原則的。其次，從法律本身來看，表親是否可以結婚，不同國家和地區的做法不同，但禁止表親結婚的人並不多。即使在中國，現代也不禁止堂兄妹結婚。比如1931年2月頒布，5月5日實施的國民政府制定的親屬法草案(第***82條)，就沒有禁止表兄弟結婚。條款是:近親結婚是不允許的，堂兄妹除外。《親屬法草案》參考了1910(宣彤二年)頒布的《大清現行法》的內容，說明在清朝壹定時期內並沒有禁止表兄弟結婚。而1950的《中華人民共和國婚姻法》並沒有禁止表兄弟結婚，只是在1980的《婚姻法》中才禁止三代以內旁系血親結婚，實際上是針對表兄弟結婚的。
第三，從優生學的角度來說，科學提供的經驗證據並不能完全證明近親結婚的後代不好或者智障。壹些現代科學研究成果和調查結果認為，表親婚姻對後代並沒有壞處。從1965到2000年8月，美國國家遺傳咨詢協會的研究人員對數千名嬰兒進行了六項大規模研究，其中包括結婚的堂兄弟的後代。結果表明，表親的婚姻對後代沒有危險。
研究指出，無血緣關系的人結婚後的後代遺傳缺陷為3%-4%，而堂兄妹的後代遺傳缺陷為4.5%。也就是說，堂兄妹結婚的後代只比普通無血緣關系的人多0.5%-1.5%的基因缺陷，平均差別只有1%。美國另壹位遺傳學家羅賓·貝內特(Robin Bennett)認為，近親結婚導致後代出生缺陷的概率只比普通人高2%-3%。換句話說，表親結婚導致出生缺陷的風險，和壹個41歲的普通女性差不多。
歷史上很多案例也證明，堂兄妹結婚並不壹定會造成後代智力低下或其他缺陷。