總要求明確堅持預防為主、防治結合、依法科學防治的原則。按照及時發現、快速處置、準確控制、有效治療的工作要求，落實“四早”措施，堅決防止境外疫情輸入和境內疫情反彈。
病原學和流行病學特征強調，主要傳播途徑仍是通過呼吸道飛沫和密切接觸，但接觸傳播或氣溶膠傳播在壹定條件下可由接觸被病毒汙染的物品和被病毒汙染的環境引起。
第壹，疫情監測是根據國內外的疫情變化。病例流行病學史強調報告病例或無癥狀感染者社區的旅行史或居留史，病例或無癥狀感染者的接觸史，更準確、更科學。第二，強調無癥狀感染者為呼吸道等新型冠狀病毒病原體檢測陽性標本，無相關臨床表現，如發熱、幹咳、咽痛等可自行感知或臨床認可的癥狀和體征，ct影像無新冠肺炎影像學特征。三是加大多渠道監測預警。要求按照點面結合、傳染病監測系統與其他部門監測系統相結合、常規監測與強化監測相結合的原則，開展對人和環境的監測工作。四是完善聚集性疫情定義，根據區劃和分級標準，將聚集性疫情由“2例及以上”修改為“5例及以上”。
在流行病學調查中，增加了輸入性病例、輸入性繼發病例、密切接觸者的密切接觸者(簡稱密切接觸者)等定義，強調做好病例調查、密切接觸者判斷、病例主動搜索、聚集性疫情調查和調查信息報告，做好傳染源、汙染範圍、傳播特征和傳播鏈分析。
壹是增加了對密切接觸者和密切接觸者的管理要求，包括管理方法、管理流程、管理要求和信息報告。二是增加了集中隔離醫學觀察期間核酸檢測的要求，要求集中隔離醫學觀察期間密切接觸者和密切接觸者分別檢測3次和1次。三是細化集中隔離和居家醫學觀察要求，制定集中隔離和居家醫學觀察指南，指導各地科學開展相關工作。
應對疫情首先是進壹步細化低、中、高風險地區防控措施，在低風險地區實施常態化防控工作，加強疫情監測和應對準備。二是科學劃定中等風險區防控區域範圍到最小單位(如學校以班級、樓房為單位、工廠以車間、工作場所為辦公室、農戶為最小單位)，啟動強化監測，實施終端消毒。根據疫情防控需要和感染風險，確定核酸檢測人群的範圍和優先順序。三是在高危地區，以學校、建築物、工廠、作業場所、自然村為最小單位劃定防控區域，采取全面入戶調查、限制人群聚集活動、區域管控等措施，啟動應急響應。
標本采集和實驗室檢測增加了基因測序的內容，要求對首例感染病例和環境監測發現的陽性標本進行溯源。
境外疫情防控調整為“7+7”和“2+1”集中隔離醫學觀察措施。入境人員在入境口岸接受海關核酸檢測後，在入境地隔離7天，自費進行核酸檢測(原則上在進入集中隔離醫學觀察點後的第五天)。檢測結果為陰性者可在家隔離7天，隔離期滿後自願自費進行1次核酸檢測。
關鍵環節防控增加冷鏈食品加工交易場所防控要求，降低冷鏈環節疫情傳播風險。
社會衛生管理和服務加強社區防控和服務、愛國衛生運動、宣傳教育和風險溝通、個人衛生和防護、精神衛生服務等措施。
在保持隔離場所設置的其他要求基本不變的前提下，將選址要求修改為“相對獨立，與人口密集的居住和活動區域保持壹定的防護距離”，有利於在確保隔離安全、避免疫情擴散的基礎上，提高城市整體隔離能力。
防控方案要求各地進壹步夯實屬地、部門、單位、個人“四方”責任，強化聯防聯控，加強能力建設，定期對轄區內疫情進行研判和風險評估，組織防控技能培訓和實戰演練，加強對重點地區、重點場所、重點人群防控工作的指導和檢查，督促落實各項防控措施。