首先，公司法在法律屬性上屬於實體法的範疇，民事訴訟法屬於程序法，從不同角度規定了類似的問題。
其次，民事訴訟法的立法是基於尊重客觀現實和市場規律，充分保障當事人的訴訟主體資格，公司法是公司內部管理關系的分配。
最後，在民事訴訟法的基礎上，分公司作為被告參與訴訟，法院依據公司法判決分公司承擔民事責任後，並不免除總公司的責任，總公司仍有清償不足部分的義務。
在當事人只選擇支行作為被告的情況下，法院可以直接判決支行承擔法律責任。當當事人選擇總公司而不是分公司作為被告時，應根據分公司的責任區別對待。分公司有較強清償能力的，應當告知當事人變更訴訟主體或者依職權追加被告。如有特殊法律規定，如以保險公司、銀行為被告的訴訟，應適用特殊規定駁回原告訴訟請求。在分公司和總公司為共同被告的情況下，如果分公司沒有較強的支付能力，可以在判定分公司承擔責任的同時，認定總公司承擔補充責任。
壹、分公司的概念界定和訴訟地位
根據現行《公司登記管理條例》的有關規定，分公司是公司設立的在其住所以外從事經營活動的組織。分公司只是外圍組織，不具備企業法人資格。壹般來說，在公司的分類上，根據管轄地和轄區的關系，可以分為總公司和分公司。具體來說，分公司是指由總公司依照法定程序設立，在其營業執照核定的範圍內從事經營活動，其經營後果最終由總公司承擔的企業法人分支機構。隨著經濟的發展和全球化進程的加快，越來越多的公司在全國各地設立分支機構，在國際上設立分支機構也很常見。隨後，在對內經濟貿易中出現了許多法律問題。根據我國現行民事實體法的規定，法人分支機構不是民事主體，不能享有民事權利，承擔民事義務。但根據民事訴訟法及其司法解釋的規定，依法設立並取得營業執照的法人分支機構是民事訴訟的主體。《民事訴訟法》第四十八條規定，“公民、法人和其他組織可以是民事訴訟的當事人。法人由其法定代表人提起訴訟。其他組織由其主要負責人提起訴訟。”最高人民法院《關於適用〈中華人民共和國民事訴訟法〉的解釋》第五十二條將“其他組織”定義為依法設立，有壹定的組織機構和財產，但不具有法人資格的組織，包括依法登記領取營業執照的“(1)個人獨資企業...(四)依法設立的社會團體的分支機構、代表機構。(五)依法設立並領取營業執照的法人分支機構；(六)依法設立並取得營業執照的商業銀行、政策性銀行和非銀行金融機構的分支機構；(七)依法登記領取營業執照的鄉鎮企業和街道企業……”；第五十三條規定“法人未依法設立的分支機構，或者雖依法設立但未取得營業執照的分支機構，以設立該分支機構的法人為當事人”。根據上述規定，我們可以將法人的分支機構分為以下幾類，下面將分別說明其訴訟地位。
(壹)未依法設立或者雖依法設立但未取得營業執照的法人分支機構。根據現行法律法規，此類分支機構未進行工商登記，不具備在境外從事經營活動的獨立資格。而是他們只是作為公司的壹個職能部門或機構，以公司的名義簽訂協議，進行壹定的經濟活動。他們在業務、資金、人事等諸多方面都受總公司管轄，在經濟上、法律上並不獨立，因此不具備作為訴訟當事人的資格。重要的是，這類分支機構的資產與公司的資產完全混淆，無法分割，其行為就是公司的行為。如果原告直接起訴該類分支機構，法院應當告知原告該類分支機構不具備訴訟主體資格，要求原告變更訴訟請求，將總行列為被告，同時由總行承擔相應責任。
(二)中國人民銀行分支機構、專業銀行、保險公司。中國人民銀行在《關於說明中國人民保險公司分支機構訴訟主體資格的函》和《中國人民銀行關於商業銀行分支機構民事責任的復函》中明確規定“因保險合同發生的糾紛由法院處理，由簽訂保險合同的分支機構作為訴訟主體進行起訴或應訴”；"
商業銀行分支機構在總行授權範圍內開展業務時，與其他公民、法人和其他組織發生糾紛引起民事訴訟的，訴訟主體應當是分支機構，而不是總行。“因此，根據我國有關法律規定，這類分支機構可以作為民事訴訟的當事人參加訴訟，並獨立承擔責任。
(三)依法設立並領取營業執照的法人分支機構。這類分支機構在工商部門取得了營業執照，同時得到了行政機關的合法確認，因此取得了開展對外經營活動的資格。對於公司而言，具有相對獨立的財產和人格，屬於《民事訴訟法解釋》第五十二條規定的其他組織類別。根據民事訴訟法第四十八條的規定，這類分支機構具有訴訟主體資格，即可以作為民事訴訟的原告或者被告。但是，根據《公司法》，“公司可以設立分公司。設立分公司應當向登記機關申請登記，領取營業執照。分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。”
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