瑞士聯邦委員會在戰時實行獨裁統治，因此可以不受限制地在政治和經濟上與納粹合作。1938年8月德國吞並奧地利後，聯邦委員會下令關閉邊境。由於擔心猶太人避難，瑞士聯邦委員會要求德國外交部在猶太人護照上加蓋J形印章。納粹壹開始並不熱衷於這個想法，他們還是想通過移民的方式盡快流放大量猶太人。瑞士和德國之間的談判持續了整個夏季和秋季。最終，瑞士威脅德國，所有德國人入境都要特別登記，納粹德國開始在猶太人的護照上加蓋J形印章。根據戰後瑞士聯邦委員會的無恥觀點，這種識別猶太人的方法成了納粹的主意。
瑞士堅持在護照上做標記的唯壹原因是為了讓他們更容易拒絕猶太難民入境。戰爭期間，瑞士拒絕了3萬多名猶太難民入境，其中大部分後來被納粹殺害。1942年8月，在宗教界和新聞界的強烈抗議下，瑞士聯邦委員會通過緊急法令，對所有猶太人封鎖邊境。即使猶太難民能通過邊檢，內地的瑞士官員也有權要求檢查他們的護照。如果護照上有J章，他們將被迫返回納粹。
瑞士政府官員從納粹對猶太人的種族滅絕壹開始就知道這些行動。德國國防軍曾經邀請許多瑞士軍醫到俄羅斯前線治療受傷的德國士兵。在德國軍隊期間，他們目睹了大量東歐的猶太平民被聚集在壹起，並被帶到樹林裏進行屠殺。
近年來，許多納粹瑞士罪犯被帶到前臺，暴露在陽光下，這是美國總統克林頓授權調查的結果。他授權參議員斯圖爾特·艾森斯塔特(Stuart Eizenstat)領導壹個實況調查團，為納粹大屠殺受害者的索賠尋求公正的解決方案。雖然“瑞士人因為擅長戰鬥而免於入侵”的傳說仍然流行，但西方國家壹直認為，瑞士在二戰期間通過向納粹出賣靈魂(和身體)保持了中立。
雖然法國淪陷後瑞士成為被軸心國包圍的孤島，但除了少數狂熱的宣傳，德國人從未認真考慮過入侵瑞士。他們知道，任何入侵只會招致瑞士人的頑強抵抗，通往意大利的戰略通道——辛普倫隧道和聖哥達隧道將被炸毀，瑞士的經濟和金融將被徹底摧毀。但以上都是次要考慮。德國沒有入侵瑞士的主要原因是瑞士本身不生產原料，除了少量的奶酪沒有多余的食物可以出口。壹個破敗的瑞士將是負擔而非收益，這也是“瑞士人用善戰換來安全”神話的來源。保護瑞士免受入侵的另壹個更重要的原因是，早在20世紀30年代中期，納粹高官(尤其是戈林)就通過瑞士的銀行隱藏了他們侵吞的財產，入侵瑞士只是將偷來的錢暴露在可疑的納粹審計人員的眼皮底下。墨索裏尼這個老小醜，想著1940入侵瑞士，南斯拉夫或者希臘，炫耀自己的法西斯威望。他後來選擇了看起來最弱的希臘作為受害者。結果被打得很慘，不得不再次爬向德國盟軍求救。
瑞士沒有西班牙或土耳其那樣重要的地理位置或戰略資源。它的煤炭嚴重依賴進口。壹旦法國淪陷，瑞士的冬季煤炭只能依靠德國。納粹從瑞士購買煤炭還有另壹個目的:從德國運來的煤炭以記賬方式結算，貨款直接存入瑞士銀行的德國賬戶。這將為德國節省大量寶貴的外匯。此外，瑞士與德國的貿易範圍還包括軸承、柴油機、機床、機車、鐘表、無線電設備，甚至武器彈藥。兩個最重要的出口是電力和鋁。
納粹擁有或控制了358家瑞士企業。納粹對263家企業的投資達到65438美元+0.1.4億美元。這些企業涵蓋了所有經濟領域:紡織業6家，交通運輸業6家，保險業15，零售批發業67家，化學工業15，機械制造業11，其他7家，每類至少3家。此外，還有9家銀行和330家股份制和財務公司。對於這筆財富的總價值，美國財政部估計為5億美元，國務院估計為7.5億到6543.8+0億美元。此外，納粹還在瑞士銀行的金庫中藏匿了大量的黃金、貨幣、寶石和藝術品。英國在戰後評估了53幅追回的畫作，價值約48萬美元。據估計，所有被劫藝術品的價值在3.9億至5.45億美元之間。