1過山車謀殺案(gin & amp；伏特加出道讓新縮小變成柯南)
2.董事長女兒被綁架(阿笠博士知道了柯南的身份，工藤新壹改名為江戶川·柯南，轉到了迪丹小學。)
4大都會代號地圖活動(少年偵探隊成立)
13離奇殺親案(宮野明美被警方抓獲)
43江戶川綁架柯南(工藤和他的妻子得知柯南的身份。)
48-49殺害外交官(服部平次出現，新壹第壹次回答)
52霧狗傳奇謀殺案(柯南得知了杜松子酒和伏特加的代號)54電子遊戲公司謀殺案(龍舌蘭酒出現並被殺)。
57-58福爾摩斯迷謀殺案(服部哲發現柯南身份)
128壹個涉黑組織搶劫十億元(宮野明美被組織擊斃)
129來自黑人組織(Ashara)的女子大學教授被害案出現。柯南第壹次得知這種藥的名字是APTX4869)
170-171黑暗中的死角(新出智明的父親被繼母殺害，在柯南的幫助下破案。新的正式亮相)
176-178與黑組織的永別(Ashen解釋說APTX4869本來就是程序性細胞死亡。苦艾酒在這裏首次亮相皮耶斯克與足原誠司的父母很熟悉，醫學的發展始於足原誠司父親的時代。GIN提到了“那位先生”，以後會經常出現。灰色原稿第壹次恢復)
188-193危急生命復活(新二次復蘇)
226-227格鬥遊戲的陷阱(朱迪出道遇到柯南，看到他在園方的幫助下破案。)
230-231神秘乘客(苦艾酒)又出現了，和足原壹起冒充新車。赤井秀壹出現了)
242元簡直是災難(海原愛提到Gin是左撇子。)
253-254這個大廳裏犯罪愛情的故事4)新來的醫生(貝爾摩假裝)可能發現柯南在分析案情，用變聲器。)
來自芝加哥的258-259人(詹姆斯·布萊克上臺)
269-270犯罪的遺物(貝爾摩竊取了與毛利小五郎有關的檔案，為了了解新案件，把美國聯邦調查局的註意力轉向毛利人，在影片的最後，赤井秀壹監視了偵探所，貝爾摩的計劃成功了)
271-272匆忙中隱藏了遺漏(朱迪在談話中暗示柯南的身份已經暴露，提到了美國聯邦調查局；；在該案中，蘭回憶說，她曾見過壹個“戴黑色針織帽的男人”()；在故事的結尾，貝爾摩給金發了壹封電子郵件，提到了雪莉，並把飛鏢送到了的交叉照片上，還有柯南和蘭的照片。
277-278英語老師VS西方名偵探(柯南基本肯定克裏斯是組織成員，並進壹步懷疑朱迪=克裏斯，和服部平次壹起去朱迪的公寓探險，但未果。最後，壹張柯南和蘭的照片出現在朱迪浴室的鏡子後面，照片上的字跡和貝爾摩的壹模壹樣。柯南最後說，除了朱迪，另外兩個可疑人物應該是赤井和信吾。)
286-288 NY事變(蘭和辛屹救了苦艾酒的銀發兇手。毛利蘭第壹次見到赤井秀壹)
289-290迷失在嚴光森林(足原透露沼淵己壹郎是該組織的成員)
307-308留下的無聲見證(小五郎受托尋找失蹤的電腦工程師板倉卓。從當事人的對話中，柯南得知他是龍舌蘭酒的聯系對象，龍舌蘭酒是壹個組織成員，在電子遊戲壹家公司的謀殺案中被殺。最後通過追查案情，柯南得到了組織的線索——板倉日記)
309-311接觸黑組織(黑組織重現，柯南與GIN第壹次正面交鋒，柯南壹度陷入危機，但最後不知是GIN放水還是疏忽大意，柯南僥幸逃脫。)
金錢買不到的友誼(阿笠博士提到，艾的父親宮野厚司是著名的瘋狂科學家，母親艾琳娜是英國留學生，黑衣組織可能在搞壹個起死回生的計劃。)
335-336東都現象的秘密(赤井秀壹跟著柯南和蘆原，最後赤井對艾的照片說“太像了”，暗示他和艾早就認識)。
338-339四保時捷(醫生)借了朱迪的車送足原回家，找了個新醫生給感冒發燒的足原看病。味美思和朱迪都找到了足原誠司的住處)
340-341藏在廁所裏的秘密(阿沙拉在她父親朋友的設計辦公室的廁所裏發現了姐姐留下的錄音磁帶。貝爾莫爾在醫生家裏安裝了壹個竊聽器，然後貝爾莫爾打電話給該組織成員卡爾·多瓦斯(Carl Dovas)尋求幫助，並且正在策劃壹項行動。)
343-344便利店陷阱(朱迪辭去了迪丹高中的老師，但蘭和嘉登去朱迪家聚會時，偶然發現鏡子後面有壹張照片)。
345月圓之夜與黑組織面對面對質的二元推理(苦艾酒、朱迪等人身份暴露，苦艾酒放棄追雪莉，藏起柯南和艾躲避琴酒。與此同時，柯南聽到了貝爾摩給這位先生發郵件時的擊鍵聲。)
346-347尋找屁股上的印記(海巴拉艾拒絕證人保護計劃。)
361-362迪丹高中校園靈異(真正的新博士歸來。)
374-375星星和香煙的代碼(山村操給他奶奶發了壹條信息，最初的按鍵音很像Boss的郵箱地址，是鳥取縣)。
385-387斯特拉迪瓦裏小提琴的不協和音(柯南知道老板的郵箱，給七個孩子)
394-396怪屋奇遇(柯南已經知道了boss的手機號)
425黑撞擊！黑人組織的魔爪伸出的那壹刻(基爾、基安蒂酒、科恩出道。黑人組織的謀殺計劃被美國聯邦調查局和柯南阻止，基爾受傷昏迷，被美國聯邦調查局俘虜。)
429-430兩個不能回頭的人(本堂瑛祐出現了。)
462-465黑色組織的影子(柯南註意到貝爾摩去水無憐奈的證人家詢問事故，本堂瑛祐在參觀毛利偵探所時有意無意地把話題引到水無憐奈，希望柯南等人調查)。
484-485黑照片的去向(柯南和海原愛調查過，得到了本堂瑛祐父親的照片)。
491-504紅與黑的碰撞(小蘭的新同學穎友總是給柯南不好的感覺。他到處尋找他的妹妹英海。瀛海看起來和水無憐奈壹模壹樣，但是她的血型不對。黑衣組織正在到處尋找水無憐奈。水無憐奈得到了美國聯邦調查局的幫助，假裝失去了知覺。被本堂的應友攻擊後，不得不說出自己的真實身份。原來，水無憐奈就是這個大廳的瀛海，取代他被謀殺的父親成為中央情報局的臥底。水無憐奈答應赤井秀壹重返組織，但他接到的第壹個任務是殺死赤井秀壹。赤井秀壹有犧牲的嫌疑。)
507-508卡拉ok包房壹角(本堂瑛祐知道柯南的身份，打算離開日本。柯南對赤井秀壹之死的態度很奇怪。)
509紅白黃偵探組F/C(水無憐奈把信息泄露給朱迪，組織了壹個強大的波旁偵探。沖矢昴出現並搬進了工藤新壹的房子。)
510柯南VS雙暗碼之謎
511推理對抗！新壹對沖矢昴(柯南發現沖矢昴推理能力強，是左撇子，愛喝波本威士忌。)
521殺人犯工藤新壹
心怡和小蘭眼淚的真實身份
523我真正想問的(新的第三次恢復)
542-543魚消失的角巖(海原愛再壹次感受到了沖矢昴的壓迫感。)
563-564偵探兵團VS強盜兵團(壹個臉上有燒傷疤痕，疑似赤井秀壹的人出現，右眼有明顯的燒傷疤痕。最終，該男子拿起劫匪的手槍，在柯南被劫匪劫持的緊張時刻向其開槍。)
578召喚危機的紅色前兆
579黑和13的暗示
580近似值的黑色時間限制
581搖曳的紅色目標(疑似赤井秀壹的人再次出現，與此同時，商場裏的朱迪老師收到了“這裏危險，快跑”的紙條。這時，沖矢昴也在商場裏，他第壹次見到了刀疤男。他說的話很有意義。刀疤男用別人的手機把商場裏發生的案件推理發給了毛利小五郎。金、基安蒂酒等人試圖測試赤井秀壹是否還活著，以此來證明基爾是否是臥底，但柯南巧妙地引走了他。與此同時，常也在尋找刀疤男，但刀疤男在瞄準時對著眼前的景象詭異地壹笑。)
616-621福爾摩斯無聲錄(新壹第四回恢復，向蘭告白。工藤和他的妻子知道海原愛是APTX4869的開發者。)
622-623緊急情況252(阿笠博士被綁架，影片結尾，海原愛再次表達了對沖矢昴的強烈懷疑。)
646-647幽靈酒店的推理對抗(世良真純出道)
651柯南VS平吉偵探推理對決(朱迪和卡姆邁耶在看到世良的照片後說世良“像某個人”，而詹姆斯第壹眼看到世良就是個女生。)
656-657醫生視頻網站(石亮看到醫生視頻裏印著海原愛的影子，從嚴光和元泰打聽“醫生家的小姑娘”(也就是海原愛)和她的鄰居(也就是)的情況。他對著沖矢昴的窗戶說，“我還以為是誰剛搬進來，現在看來，真是杞人憂天……”最後，世良把視頻中灰色平原的意外圖像從電腦中刪除了。)
667-668年婚禮前夕(安石頭出場，成為小五郎弟子。)
671-674偵探的噩夢(沖矢昴脫口而出“不要露出那種表情”，這似乎讓阿沙拉感到相當在意。苦艾酒打電話給波旁，安子頭、沖矢昴和世良真純同時接到電話)。
675-676壹點都不原諒(足原誠司回憶了沖矢的那句“不要露出那種表情”，和曾經組織過臥底的諸興達(也就是赤井秀壹)用的詞很像。世良真純似乎很早就知道了工藤新壹，對海原愛表現出了興趣，並關註了傷疤。
681-683以生命為賭註的愛播(最後安石頭為高木的指導警官伊達掃墓，暗示兩人是朋友)
684-685泡沫、蒸汽和香煙(足原的動作和兩人的對話表明千葉的脖子裏藏著壹個秘密)
690-691未解事件(行為可疑，世良在房間裏發現了關於女人的線索，最後世良含淚回頭看了柯南和蘭壹眼，說:“果然，我是個壞孩子。”)
699-700接近阿沙拉的秘密的黑影(偵探隊被困，阿沙拉要服用解藥才能恢復，被廣彥拍下，被世良、安石、沖矢看到。)
701-704黑暗快車(世良真純，安士通身份暴露。黑組又出來了，目標是雪莉。海東·黑場受柯南委托，假扮成宮野誌保，進入最後壹節車廂。馬車掉下後，貝爾莫爾引爆炸藥，基德乘滑翔翼逃脫。貝爾摩發現雪莉沒死後，沒有向組織匯報。安世頭對阿凱的死因有懷疑，準備重新調查。沖矢昴展示了和赤井秀壹壹樣的眼睛。)
705密室中的柯南(波旁繼續以救護員的身份出現)
706在波旁面前解謎(波旁發現柯南用了腕表麻醉針，對其產生了興趣，並懷疑“沈睡的小五郎”與柯南的聯系)。
722-723甜冷快遞(安世頭解開柯南的求救信號，救出被困在冰凍快遞車裏的少年偵探團。沖矢昴透過樓上的窗戶看著他離開。)
724-725黑戶黑羽和紅臉美人魚(石良飾)提到了“神秘列車”上帽子丟失的事，問小蘭有沒有看過“刀疤紅井”。這句話揭示了這頂帽子對她的重要性以及她哥哥壹休的想法，他認為這頂帽子已經“死了”。)
727-728裝滿水果的百寶箱(柯南出來了:“妳不應該和我在壹起(妳在哪裏看到的)……”)，但被發現屍體打斷了。小蘭看著石梁匆匆的背影，忍不住說了壹句“浪”，對園子說:“看著石梁奔跑的背影，耳邊總會蕩漾起浪花。”案子結束後，柯南悄悄走出來:“妳在哪裏見過我？”但石亮沒有直接回答，心想:“對不起，我現在不能告訴妳，因為還不到時候……”)
朱蒂的追憶與賞花陷阱(柯南告訴朱蒂，刀疤阿凱在假扮波旁，要她調查安沒有離開波洛咖啡館的原因。波旁和貝爾摩在銀行劫案中假扮宮崎駿的“妻子”，在朱迪身上安裝竊聽器。波旁竊聽柯南與朱迪的對話，稱柯南為“可怕的男人”。)
739小五郎在壹家酒吧(第二部)(柯南通過與高木警官的談話發現，在神社事件中，欣賞櫻花的遊客宮崎康弘和他的“妻子”假裝是波旁和貝爾莫德。)
嫌犯是京極真嗎？(石亮提到了他的二哥。石亮和他二哥好像知道柯南的身份。二哥問石亮有沒有見過“魔術師”。)