深化對智庫功能的認識
過去，人們認為智庫的功能只是為政府提供決策服務。中國科學技術發展戰略研究院王元明確指出，從整個社會發展歷史來看，智庫的壹個非常重要的功能就是引領社會未來發展的主流和先進的思想和精神。對未來的先進性和主流思想的闡述，雖然多樣或矛盾，但永遠是前進的方向。思想庫是推動社會進步的壹個非常重要的功能，應該得到更多的關註。
培育意識形態產品市場
智庫是產生思想和智慧的人才庫。現在的“圖書館”很多，“智慧”的質量不高，圖書館裏沒有足夠的原始產品和思想。對此，中國國際經濟交流中心總經濟師陳文玲認為，應該引導壹些官方和半官方智庫行政化轉型為第三方獨立智庫。使其在深入研究和不斷研究的基礎上發表獨立意見，並逐步走向市場，在為決策者和市場需求者提供思路方面形成平等的智庫競爭機制。誰的思想有影響力，誰的觀點和建設性意見或戰略設計對國家戰略、國家決策、國家政策及其社會有重大貢獻，誰就應該在競爭中脫穎而出。
中國社會科學院經濟研究所張小靜認為，智庫就是智庫。良好的思想市場環境是智庫生存發展的土壤，是獨立精神的培育。在這個思想的市場裏，應該會有大量多元化的思想產品。在開放的環境下，每個人都可以獨立發表意見，從而集中大量的思想資源，刺激思想產品的不斷生產。
王元業指出，在諸多因素中，決策行政機制對智庫的影響更為深刻。決策行政機制決定了意識形態市場的規模、供給渠道和市場多樣性。沒有決策的需求，就不可能創造出多元化、規模化、嚴肅化的思想市場。
創新智庫輸送和管理機制
良好的智庫運行管理機制是建設新型智庫的重要內容，它涉及到智庫的科學研究、人事管理和成果發布。對此，陳文玲主張借鑒發達國家智庫運營管理的經驗，引入他們的制度設計，消化吸收創新，由壹個部門負責設計並轉化為適合中國國情的政策。在頂層設計中，應該給予智庫參與決策的機會。只有了解國家需要什麽，才能提供符合需求的智庫產品。此外，智庫要建立轉化機制，將研究成果轉化為決策報告、重要論文和有影響力的著作，拓寬轉化的方法和路徑，更有效地為決策服務。
國務院發展研究中心社會發展研究部葛延風也強調，推動智庫發展，需要建立良好的激勵機制，包括待遇水平、發展機會、平等自由的研究氛圍和環境、研究視野、成果發布渠道等。，綜合運用各種激勵措施，充分調動科研人員的積極性。當然，也需要建立必要的約束機制來規範行為。
重視戰略研究
針對中國智庫的研究現狀，國務院參事室劉艷華認為，國外很多知名智庫都投入了大量資金研究中國的發展戰略，比如中國的能源發展戰略等，並得出了許多具有政策指導意義的結論。反觀我國，信息豐富，科研積累良好，但更註重研究技術，對戰略研究關註較少。其實戰略失誤才是最大的失誤。我們應該建立壹流的智庫，為壹流的科學家提供充足的資金，讓他們創造想法，營銷想法，並將其轉化為政策。
陳文玲還指出，美國有2000多個智庫，研究力量非常強大。這些智庫對壹些課題研究多年，對壹些重大問題有非常強的戰略儲備，甚至深入到具體的實施環節、談判重點等等。中國智庫在競爭力和戰略設計能力方面面臨嚴峻挑戰。如何對重大國際戰略問題進行深入研究；如何打破部門分割，在國家層面進行跨領域的綜合性戰略研究。這是壹個必須考慮的重大問題。
強調智庫的內功。
練好內功也是建設新型智庫的重要內容和必然要求。智庫的內功包括智庫人員的研究能力、智庫產品的質量和品種、支撐智庫產品生產的數據和知識庫以及設施建設。對此，葛延風指出，目前壹些智庫的研究成果質量不高，主要是有些成果缺乏足夠的理論和實踐依據，文筆千篇壹律，往往著眼於過於宏觀的改革方向和原則，而在具體的方案設計，尤其是可操作的政策設計上力度不夠。這與研究習慣和表達方式有關，但更大程度上說明智庫整體研究能力，尤其是運營整體研究能力不足。因此，必須努力提高研究能力，加強理論與實踐和國內外經驗的結合，突出可操作性的政策研究，加強比較分析和政策評估。
中國科技信息研究所的趙之雲強調，中國智庫面臨著外部環境、運行機制和管理體制等諸多問題。但更重要的是，智庫需要知道自己為誰提供產品，應該提供什麽產品，提供的產品是否是決策者需要的，質量是否值得信賴。趙之雲進壹步指出，智庫的產品壹般分為三類:第壹類是參考研究報告，其核心是梳理和總結國外的經驗和做法及其對中國的啟示。第二類是分析研究報告，要先把道理講清楚，再把問題分析清楚。第三類是政策研究報告。面向政策的研究報告需要滿足客戶的具體需求。首先要了解政策制定和適應的環境；其次，要合理合法，在合理合法的框架內滿足決策者的政策需求；再次，要明確政策可能產生的後果，具有可行性和可操作性。如果可能性分析不夠，沒有把握政策實施的可能後果，就可能導致誤導和偏差。
王元認為，中國官方智庫承擔了很多短期的政策研究任務，使得中國智庫在政策的不斷演進、實際觀察和對問題的把握上不斷積累。但問題是，中國的官方智庫並沒有建立壹個非常持續的數據基礎和相應的研究範式。因此，他強調，中國智庫需要建立自己的數據和知識支撐基礎，將過多的實證研究轉向更加科學規範的研究。