制定本系統年度工作計劃、相關工作制度和長遠發展規劃；處理局機關日常事務，組織重要文稿的起草和審核；負責文電、機要、會議、檔案、督查、信訪、保密、密碼等工作；承辦面向社會的稅收宣傳、新聞發布、政務公開和政府信息公開工作；
承擔網站的運行和維護；組織稅收科研、學術交流和科研成果的鑒定、評選、推廣和獎勵；負責本系統的目標管理考核和監督；組織實施綜合行政管理信息系統的日常維護；辦理NPC代表和CPPCC委員建議的有關事項；協助局領導綜合協調相關工作。
(2)政策法規司
組織實施綜合稅收政策；負責相關政策法規的調查、研究、宣傳和培訓；負責貫徹、建立和實施規範稅收執法的規章制度；承擔本機關相關規範性文件的合法性審核；承辦局外綜合性稅收政策文件工作；承辦重大稅務案件的審理；
辦理行政復議、賠償案件和行政訴訟案件；組織對稅收法律法規、部門規章和規範性文件實施情況的監督檢查，承擔稅收執法質量評估；配合財政、審計等部門對稅務部門進行監督和審計。
(3)商品和服務稅辦公室
組織實施增值稅、消費稅、營業稅和車輛購置稅的征收管理，制定具體的征收管理實施辦法；解釋和處理與稅務相關的具體業務問題；組織實施相關稅種的納稅評估和稅源管理；指導相關稅收的日常管理和檢查；
承擔增值稅專用發票的管理工作；參與與稅收有關的納稅輔導、咨詢服務和稅收法律救濟工作；負責金稅工程流轉稅業務的管理、推廣應用、認證和稅務備案、數據采集和審計管理。
(4)所得稅辦公室
組織實施企業所得稅、儲蓄存款利息所得稅和法律法規規定的基金(費)的征收管理，制定具體的征收管理實施辦法；
解釋和處理與稅務相關的具體業務問題；組織實施納稅評估、稅源管理、稅基管理、匯算清繳等措施；指導相關稅收的日常管理和檢查；參與與稅收有關的納稅輔導、咨詢服務和稅收法律救濟工作。
(5)財務室
牽頭編制年度稅收計劃、出口退(免)稅計劃，下達年度免(免)稅轉移計劃；監督檢查納稅和退稅情況；開展稅收分析預測、稅收能力測算、重點稅源監控和企業稅收數據調查；承擔稅務會計、統計核算、稅收票證管理等相關工作；
承擔稅收數據的綜合管理和應用；負責管理延期納稅，壞賬稅和死亡稅的註銷。
(6)辦稅服務廳
組織、協調、指導本系統各部門、各稅種、各環節的納稅服務工作；組織實施納稅服務工作規範和操作規程；組織實施保護納稅人權益的規章制度和規範性文件；組織協調實施納稅輔導、咨詢服務、稅收法律救濟等工作，受理納稅人投訴；
指導稅務糾紛的調解；承擔12366熱線、網站納稅服務專欄、短信系統的運行管理；負責稅務代理工作的監督、管理和指導。
(7)辦稅服務廳
負責納稅人在稅務機關辦理的各類涉稅事項，包括稅務登記、納稅申報、稅款征收、稅款繳納、欠稅公告、發票購售、稅法(宣傳)公告、金稅發售、納稅申報審核、咨詢輔導、受理減免稅申請及相關優惠政策。
為提高社會保險基金的征管效率，將基本養老保險費、基本醫療保險費、失業保險費等各項社會保險費交由稅務機關統壹征收。國稅、地稅機構合並後，實行以中華人民共和國國家稅務總局為主體，省(自治區、直轄市)政府雙重領導管理體制。
國家稅務總局要會同省級黨委、政府，加強稅務系統黨的領導，抓好黨的建設、思想政治建設和幹部隊伍建設，優化各級稅務組織體系和稅收征管職責，按照“瘦身”與“健身”相結合的原則，完善結構布局和權力配置，構建優化高效統壹的稅收征管體系。
百度百科-中華人民共和國國家稅務局