我國微生物菌種資源的保存起步較早，但發展過程曲折。我國現代微生物菌種的保存始於20世紀20年代，但只有零星的菌種保存在相關的釀造實驗室。建國前國家處於戰亂時期，不重視微生物種質資源的收集和保存，也沒有專門的機構。菌種保藏、檢測和鑒定的技術和設施相當落後。方先生在黃海化學工業研究所收集和保存大量菌種資源是在20世紀30年代後期。新中國成立後，壹些科研院所相繼成立了微生物菌種保藏組，如中國農業科學院土壤肥料研究所，收藏根瘤菌、微生物肥料、農用抗生素等農用微生物菌種，中國醫用生物制品檢定所，收藏醫用細菌微生物菌種。1979年，在原國家科委的組織領導下，召開了第壹次全國菌種保藏大會，成立了中國微生物菌種保藏管理委員會和六個專業保藏管理中心。1984年7月，第二次全國菌種保藏工作會議召開，成立了第七個專業保藏管理中心，為壹般微生物、農業微生物、工業微生物、獸醫微生物、林業微生物、醫學微生物、抗生素(後改為醫學微生物)中心。七個中心在各自專業領域收集、鑒定、評價、保藏和供應微生物菌種，並承擔國際交流任務。此後，教育部和國家海洋局成立了典型培養和海洋微生物菌種保藏管理中心。在國內，除了上述9個微生物菌種保藏管理中心外，壹些高校和科研院所的研究人員也在從事專業的、有特色的微生物菌種資源的收集、鑒定和保藏工作，如中國農業大學根瘤菌微生物菌種保藏中心。自2003年以來，在微生物項目組的組織和協調下，形成了以9個中心為核心，以專業特色的采集、保存和鑒定為支撐的全國性微生物菌種資源服務網絡。多次出版微生物菌種目錄，開發建設了10個網站和數據庫檢索系統。長期以來，壹直有專門的科技人員從事微生物菌種的鑒定、保藏、評價和檢索工作。
參與項目建設的單位分屬農業部、教育部、中科院等8個部門，參與項目建設的80多個項目單位分布在23個省的27個城市。* * *約有970人參與該項目。項目人員中，高級職稱470多人，中級職稱280多人，初級職稱140多人，其他80人，其中博士260多人，碩士240多人，學士280人，其他學歷180多人。
根據《微生物種質資源描述規範》，結合微生物種質保存的需要，參考OECD BRC工作組推薦的微生物種質數據信息內容，項目承擔單位將完成與E- platform相對應的統壹數據結構、統壹功能的微生物種質資源信息管理模塊系統的開發，並提供給項目參與者使用。該模塊包括微生物菌種資源信息數據庫、培養基數據庫、文獻數據庫和資源管理單位信息數據庫，* * *包含111數據項，涵蓋菌種名稱、來源、生物安全性、用途、培養和保藏方法，* * *享用和利用、文獻、分類學特征(形態、理化性質、化學和分子特征)並根據實際應用情況，* * *描述標準的修訂情況，以及E- platform的需要，不斷進行調整和完善。此外，項目組按照“擇需擇重”的原則，開發了細菌、酵母、放線菌、小型絲狀真菌、食用菌、病毒等數據庫。