各級發展改革委、建設、水利、國土資源、衛生、農牧、林業等有關部門應當按照各自職責，做好飲用水水源保護工作。第五條單位和個人有保護飲用水水源保護區環境的義務，並可以對汙染和破壞飲用水水源保護區環境的行為向人民政府和有關部門舉報。第六條對保護飲用水水源做出顯著成績的單位和個人，由縣級以上人民政府給予表彰和獎勵。第二章飲用水水源保護區的劃分和水質標準第七條根據取水方式的不同，飲用水水源保護區分為地表水源保護區和地下水源保護區。地表水水源保護區分為河流水源保護區和湖泊、水庫水源保護區。
根據保護要求，分為壹級保護區、二級保護區和準保護區。第八條河流飲用水水源保護區分為:
(壹)壹級保護區:上遊1000米至下遊100米的水域和取水點河岸兩側200米以內的陸域；
(二)二級保護區:壹級保護區上邊界上遊2000米的水域和河岸兩側200米以內的陸域；
(三)準保護區:從二級保護區的上邊界向後退5000米的水域和河岸兩側各200米的陸域。第九條湖泊、水庫飲用水水源保護區壹般分為:
(壹)壹級保護區:取水點周圍半徑500米的水域和陸域；渠道出口至其取水點的水域和渠道兩側各200米範圍內的陸域；
(二)二級保護區:包括壹級保護區以外的全部水域和正常蓄水線以上200米以內的陸域，以及流入湖泊、水庫的河流入口上遊2500米的水域及其兩岸200米以內的陸域；
(3)準保護區:二級保護區上邊界上遊5000米的水域和河岸兩側200米以內的陸域。第十條地下水飲用水水源保護區壹般分為:
(壹)壹級保護區:以取水井為中心，半徑30米範圍內；
(2)二級保護區:以取水井為中心，30米至60米影響半徑範圍內；
(3)準保護區:根據地下水的補給徑流條件確定，壹般限於二級保護區外100米半徑範圍內。第十壹條劃定地表水飲用水水源保護區，由有關市(地)、縣人民政府協商提出劃定方案，報自治區人民政府批準。協商不成的，由自治區人民政府環境保護行政主管部門會同同級發展改革委、建設、水利、國土資源、衛生、農牧、林業等有關部門提出劃定方案，報自治區人民政府批準。
地下水和飲用水水源保護區的範圍，由縣級以上人民政府環境保護行政主管部門會同同級發展改革委、建設、水利、國土資源、衛生、農牧、林業等有關部門劃定，報本級人民政府批準，並報上壹級人民政府備案。
跨市(地)、縣的地下水飲用水水源保護區的位置劃定和管理辦法，應當經保護區內有關人民政府同意，並報上級人民政府批準。第十二條縣級以上人民政府結合當地實際情況，確需擴大或者縮小地下水飲用水水源保護區範圍的，應當報上級人民政府批準。第十三條劃定飲用水水源保護區應當明確地理界限。
飲用水廠必須在保護區邊界設立標誌或標樁。第十四條地表水和飲用水水源保護區的水質標準應當符合下列要求:
(壹)壹級保護區的水質不得低於國家規定的《地表水環境質量標準》ⅱ類標準；
(二)二級保護區的水質不得低於國家規定的《地表水環境質量標準》ⅲ類標準；
(三)準保護區的水質按照國家規定的《地表水環境質量標準》ⅲ類標準控制。第十五條地下水飲用水源保護區的水質標準適用於國家《地下水質量標準》ⅱ類標準。第三章地表水和飲用水水源保護第十六條在地表水和飲用水水源保護區內，禁止下列活動:
(壹)破壞水環境生態平衡，破壞水源涵養林、護岸林或者與水源保護有關的植被的活動；
(二)傾倒工業廢渣、生活垃圾、糞便和其他廢棄物；
(三)裝載有毒有害物質、油類、糞便且無防滲、防溢、防泄漏設施的車輛通過保護區的；
(四)使用劇毒和高殘留農藥；
(五)使用炸藥和毒藥捕殺水生動物。