1、目前各金融體系的建設標準很難統壹，阻礙了金融信息化的進壹步發展。在國有商業銀行全面實施國家金融信息化標準前，許多銀行都已經建立了自己的體系，由於機型、系統平臺、計算機接口以及數據標準的不統壹，使得各地的差距比較大，系統的整合比較困難，標準化改造需要壹段時間。
2、金融信息化建設中，金融企業之間的互聯互通問題難以得到解決。如國內眾多的銀行卡之間要實現互聯互通，似乎需要經過壹番長途跋涉。其實，為了實現銀行卡的互聯互通，中國人民銀行早就牽頭組織各商業銀行***同出資成立了銀行卡信息交換中心，以解決各銀行之間的 ATM和POS機的***享問題。可是真正要實現聯通的時候，各銀行又都在盤算自己的利益。因為銀行卡的聯通意味著小銀行可以分享到大銀行的資源，大銀行當然不願意了。因此，金融企業的互聯互通，必須找到壹種市場驅動機制來諧調各方的利益，找到最佳的利益平衡點。
3、服務產品的開發和管理信息的應用滯後於信息基礎設施的建設和業務的快速發展。目前國內金融企業的計算機應用系統偏重於櫃面的負債、核算業務的處理，難以滿足個性化金融增值業務的需要。同時，缺乏對大量管理信息、客戶信息、產業信息的收集、儲存、挖掘、分析和利用，信息技術在金融企業管理領域的應用層次較低，許多業務領域的管理和控制還處在半信息化的階段。
4、網上金融企業的認證中心建設速度緩慢。目前中國各金融企業的客戶很多，都是網上的潛在客戶，然而由於國內金融企業在建設認證中心的意見上難以實現統壹，使得網上金融的認證標準沒有統壹。而外資金融企業又虎視耽耽，壹旦外資進入，美國標準、日本標準將在中國大地上大行其道。分析人士認為，網上認證中心不解決，那麽網上金融將不能成為真正意義上的網上金融。
5、實現數據大集中與信息安全的矛盾。數據大集中意味著統壹管理，減少重復建設，數據集中以後，能夠有效地提高金融企業的管理水平，加強金融風險的防範，進壹步提高資金的流動性和資金營運的效率，有效地改善金融企業的管理機制。而且，數據集中是實現各種新業務和新服務的前提基礎。然而，數據大集中雖是金融信息化的壹大趨勢，但集中從某種角度上講增加了系統的不安全性，壹旦某壹地方的系統出了問題，那全國的系統都將受到影響。
中國的金融信息化被業內人士認為是“起步晚，卻發展迅猛”。但與國外的金融企業相比，我們還停留在金融信息化的初級階段。目前國內已經上馬信息化的金融企業大多只是為客戶提供信息查詢而已，提供理財、咨詢服務的不多。國外的經驗告訴我們，金融信息化不是為了向客戶提供壹批簡單的海量信息，而是要向客戶提供個性化的金融服務，成為客戶的投資理財專家，為客戶整合加工所有的信息，分析投資動態，推薦投資產品等。總而言之，金融業的信息化進程可以概括為：以數據大集中為前提，以完善的綜合業務系統為基礎平臺，以數據倉庫為工具，以信息安全為技術保障，打造出現代化、網絡化的金融企業。