問題二、部門有名無實。很多企業雖然建立了完善的職能部門，但由於老板的強勢和事必躬親，直接插手或代理著許多部門的工作，導致部門功能無法發揮。有些企業雖然也有部門負責人，但實際的運作卻由老板直接指揮。多頭管理、交叉管理直接導致分工不明、責任不清。最終，管理效果依賴於老板個人，老板從早累到晚，卻累而低效。
問題三、不懂得分權。很多企業只懂得在部門分權，如品管部有品質管理權與品質監控權。卻沒有在部門間、崗位間分權，導致壹個部門集決策權、執行權、監督權於壹身，其實質還是集權管理，只是從老板的集權轉變到部門集權，而在部門間、崗位間卻沒有形成相互監控、相互分權的關系。如有的企業，生產管理方式就是由車間自主制訂計劃、自行安排生產及跟進，由於缺乏外部的監控與約束，導致車間生產隨意性大，生產效率低下。 問題四、部門歸屬不合理。由於對分權本質不了解，導致部門歸屬不合理。如有的企業將品管部歸屬生產部管理，將倉庫劃歸采購部管理。監控部門劃歸作業部門管理，無法形成相互制約的關系，必然造成很多的問題得不到暴露，管理改善更是舉步維艱。如倉庫劃歸采購部管理，如采購亂購物料，倉庫就肯定不會說，因為采購是他的上級。
企業在機制建設上必須解決的壹個問題就是“結構”問題。什麽樣的“結構”將產生什麽樣的運作，什麽樣的運作將產生什麽樣的效果。“結構”的重要性不言而喻。然而，“結構”的合理性卻是很多企業老板包括管理者所不明白的。