在進行論文查重時，系統會主要檢測論文中的文本內容，包括文字、句子和段落等。壹般來說，查重系統會將論文與學術數據庫進行比對，以確定是否存在與其他已發表的論文相似或重復的部分。此外，查重系統還會對論文中的圖表、引用文獻和參考資料等進行檢查。
然而，論文查重系統是否會檢測年報內容則需要根據具體情況而定。壹般來說，年報內容與研究生畢業論文的撰寫有壹定的關聯，因為年報通常會包含壹些研究進展和成果。因此，在某些情況下，查重系統可能會對年報內容進行檢查。具體來說，如果年報中存在與研究生論文相似或重復的文本內容，查重系統有可能會將其檢測出來。
然而，需要註意的是，研究生畢業論文和年報是具有不同目的和寫作方式的文本。研究生畢業論文通常是壹種系統性的學術論文，需要包含研究目的、方法、結果和結論等部分，以及詳細的引用文獻和參考資料。而年報通常是對壹年研究進展的總結和報告，更加偏向於項目進展和成果的匯報。因此，查重系統在檢測年報內容時可能會與研究生畢業論文的檢測方式有所不同。