公司可以去社保中心辦理該員工的社保終止手續後，就能刪除該員工信息。
註意事項：
1、先在企業的所在轄區開立企業社保帳戶；
2、將企業內已參保的員工社保關系轉入本企業帳戶；
3、在社保繳費首月在社保打印繳費明細單（明細單上包括員工的姓名、身份證號、繳費基數等）；
4、辦理同城委托扣繳社保手續（這是到企業開戶銀行辦理）；
5、以後每月只需向社保提交參保人員增加或減少表；
由於各地的開立企業社保帳戶所需資料不壹樣及辦理增加員工社保手續也不壹樣，政策也經常調整，所以具體所需資料應按所在轄區社保規定辦理。
擴展資料：
離職時企業對員工的五險壹金和檔案的處理如下：
1、養老保險轉移手續
攜帶包括參保人員居民身份證、解除勞動關系證明、居民戶口簿等相關證明材料，到目前所在地的社保經辦機構打印《基本養老保險參保繳費憑證》；
帶齊所有手續，填寫《轉移接續申請表》，向轉移地的社保機構提出轉入申請。只要審核通過，參保者將在45個工作日後接收到社保部門完成轉移的通知。
2、醫保賬戶可隨人劃轉。
當勞動者離職之後到新城市就業，即可加入當地的城鎮職工基本醫療保險。
新就業地社保經辦機構將通知原就業地社保經辦機構辦理轉移手續，勞動者不再享受原就業地城鎮基本醫療保險待遇，原就業地在中止參保手續的同時出具參保憑證備查。
3、工傷及生育保險
這兩種保險屬於“當期交納當期享受”的險種，並不存在轉移的問題。
4、失業保險轉移
城鎮事業單位成建制跨統籌地區轉移，失業人員跨統籌地區流動的，失業保險關系隨之轉遷。
如需辦理手續，在職職工在本省內或向外省遷移，應到受理其原單位失業保險業務的經辦機構辦理失業保險關系轉移手續。
失業人員領取失業保險金期間在本省內跨統籌地區轉移的，由遷出地經辦機構出具證明，失業人員憑證明和《職工失業保險手冊》到遷入地經辦機構接續失業保險關系，並按遷入地標準領取失業保險金，不需劃轉資金。
4、公積金異地購房只能壹次性提取
按規定，個人到外地工作，如果他在外地的工作單位已為其建立了住房公積金賬戶，那麽他就可以將在原來住地的住房公積金賬戶內的全部金額，轉移到外地的住房公積金賬戶內。
辦理時，該員工需要提供調入單位接收證明、在調入地建立住房公積金的證明、轉入銀行賬號、開戶行名稱、職工本人身份證復印件等相關材料給在原居住地的原單位，通過原單位的住房公積金經辦人到開戶管理部申請辦理。
因地區差異，各個省市會有所不同，具體需咨詢當地社保局和公積金管理中心。
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