1、設立條件不同：
公司制企業：公司制企業是指按照法律規定，由法定人數以上的投資者(或股東）出資建立、自主經營、自負盈虧、具有法人資格的經濟組織。
個人業主制企業：由個人出資經營的企業。出資者就是企業主，掌握企業的全部業務經營權力，獨享企業的全部利潤和獨自承擔所有的風險，並對企業的債務負無限責任。
合夥企業：合夥企業是由各合夥人訂立合夥協議，***同出資，***同經營，***享收益，***擔風險，並對企業債務承擔無限連帶責任的營利性組織。
2、事務執行不同：
公司制企業：無限存續（壹個公司在最初的所有者和經營者退出後仍然可以繼續存在）、有限債務責任、所有權的流動性強、資本市場的優越地位。
個人業主制企業：企業建立與歇業的程序簡單易行，企業產權能夠較為自由地轉讓；經營者與所有者合壹；所有者的利益與經營者的利益時完全重合的；經營者與產權關系密切、直接，利潤獨享，風險自擔，經營的保密性強。
合夥企業：與個人獨資企業相比較，從眾多的合夥人處籌集資本，合夥人***同償還債務，減少了銀行貸款的風險，使企業的籌資能力有所提高；合夥企業能夠讓更多投資者發揮優勢互補的作用，比如技術、知識產權、土地和資本的合作，並且投資者更多，事關自己切身利益，大家***同出力謀劃，集思廣益，提升企業綜合競爭力；
3、組織機構不同
公司制企業：公司作為獨立的法人，其利潤需交納企業所得稅，企業利潤分配給股東後，股東還需交納個人所得稅。公司法對於建立公司的要求比建立獨資或合夥企業高，並且需要提交各種報告。
個人業主制企業：投資人可以自行管理企業事務，也可以委托或者聘用他人負責企業的事務管理。
合夥企業：註冊公司的組織形式，由《公司條例》詳為規定，合夥的組織形式則相對靈活，只要不違反法律，可由合夥人以協議決定。
擴展資料：
在市場經濟中，與其他市場主體相比，公司有以下優點：
市場經濟要求平等的市場主體按照等價交換的原則；通過公平競爭，從市場取得和向市場提供商品，促進整個市場合理流動，實現結構架置優化、資源合理配置。
市場經濟的要求決定了市場主體必須擁有明晰界定的財產權，而且必須是獨立的、平等的。法人制度以其獨特的性質使法人在市場經濟中充當了主要的角色。
公司作為法人的壹種形態，其特質完全符合市場經濟的要求，這必然是公司成為市場經濟的主體。
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