特點之壹是自主知識產權占據主導地位。
高新區企業研發生產的具有自主知識產權和品牌的產品在國內外具有廣泛的影響力，成為深圳自主創新的主要特色。2011年專利申請量為12748件，其中發明專利8966件，占深圳發明專利申請量的31%，PCT申請量3779件。
第二個特點是不斷完善的高科技產業鏈。
高新區已形成通信產業集群、計算機產業集群、軟件產業集群、醫藥產業集群、新材料產業集群和光機電壹體化產業集群。隨著產業規模的不斷擴大和經濟社會效益的同步增長，該地區聚集和培育了壹批產業優勢突出的骨幹企業，其中年銷售額超億元企業153家，國家高新技術企業540家。深圳灣園區培育了81家上市企業。
第三個特點是多元化、專業化、互動化的孵化器群體。
由政府、大學、留學生社團等共同創辦的孵化器團體。已經形成，為“創業板”和“新三板”市場培育了壹批優質企業資源。“深圳高新區孵化器聯盟”進壹步聚合創新資源，推動區內科技型中小企業快速成長；高新區“創業投資服務廣場”正在為高新技術企業提供投融資和創業服務。
第四個特點是名校聚集在高新區。
匯聚國內外53所知名高校的深圳虛擬大學園經過13年的發展，已培養研究生超過33926人，引進博士後85人，孵化企業704家，校企合作項目1247個。由103國家級科研機構組成的深圳虛擬大學園重點實驗室平臺，正在為企業的技術創新提供支撐。“深圳虛擬大學園國家大學科技園”正在建設中。深圳虛擬大學園已成為高層次人才培養、重點實驗室建設、科研成果轉化和產業化的基地。
第五個特點是科技和金融的結合日益完善。
多年來，深圳高新區堅持市場化、企業化原則，積極探索科技與金融結合的方式方法，較早開展了風險投資、私募股權投資、科技投融資體系、科技金融產品創新、科技金融合作平臺等創新嘗試。目前，高新區已聚集了由6家境內外證券交易所常駐機構、46家銀行分行、8家證券營業部、180多家國內外知名創業投資私募基金公司、20多家擔保評估機構、20多家律師、會計師、審計師組成的投融資服務體系，為企業提供多層次、全方位、多元化、壹站式的投融資服務，實現了科技與金融的滲透融合。
第六個特點是國際科技園區。
作為國際科技園協會和亞太經合組織科技園成員，深圳高新區建立了“深圳國際科技商務平臺”，來自33個國家和地區的46家境外機構入駐國際平臺。
2007年，深港創新圈合作協議正式簽署。深圳高新區正致力於“深港創新圈”建設，以具有國際影響力的領域、重要的國家戰略、對區域發展的貢獻為導向，促進兩地資源共享、教育同構、溝通便利，探索構建深港區域創新體系新模式。
2009年3月，深圳高新區與香港科技園共建“深港創新圈互動基地”，加強兩地企業交流合作，共同開拓境內外市場。
面對新的機遇，迎接新的挑戰。2009年8月，市政府制定了《深圳市高新技術產業園區發展專項規劃(2009-2015)》，承擔了“拓展產業空間、完善產業鏈、優化產業結構”的歷史責任。高新區涵蓋深圳灣、劉閑洞、大學城、福永北-沙井南、光明、石巖、觀瀾、龍華、阪雪崗、寶龍、碧嶺、坪山(深圳出口加工區)、葵湧、大鵬等市政府指定的高新技術產業開發區，總面積185.6平方公裏，包括高新技術產業。
深圳高新區規劃建設了壹批科技企業加速器和專業園區，初步實現了土地資源的集約、節約利用和動態配置，為建設“國家創新型城市”和“深港創新圈”提供了堅實保障。