1.企業所得稅申報表及附表可以與關聯交易報告分開保存，但錄入後保存數據時應給出提示。“企業與關聯方發生業務往來、境外投資或對外支付的，請按稅法規定填報關聯交易報告”；
2.從年度所得稅申報表及明細表模塊傳到相關業務往來報告模塊時，增加壹個提示對話框:
對話框1:“是否存在關聯關系和關聯交易(是/否)？選擇“是”的，應填寫企業年度關聯交易報告表1至表7的內容；如果選擇“否”，則不會填寫後續的相關報表。當彈出上述對話框時，會提示以下信息:
《中華人民共和國企業所得稅法》第四十三條:企業在向稅務機關報送年度企業所得稅申報表時，應當就其與關聯方的業務往來，附具年度關聯業務往來報告。
特別納稅調整實施辦法(試行)第105條:企業未按照本辦法規定向稅務機關報送關聯業務往來年度報告表，或者未保存同期資料或者其他相關資料的，按照稅收征管法第六十條、第六十二條的規定處理。
對話2:“是否有外國投資(是/否)”？選擇“是”的，填寫企業年度關聯交易報告表8；如果選擇“否”,它將留空。"
對話三:“有對外支付(是/否)”？如選擇“是”，填寫企業年度關聯交易報告表9；如果選擇“否”,它將留空。"
3.提供“tab頁”填寫相關業務交易報表。
4.表3至表8涉及的關聯方名稱均由表1“關聯表”控制，不再需要手工添加，均可根據本企業表1自動帶出(結合模糊篩選功能快速定位)。
5.所有報表應滿足錄入、修改、保存、多格式輸出、打印、填寫、解釋和查詢功能。
6.在年度所得稅申報或申報開票抵扣給出“申報成功”消息前，系統應對申報表的完整性進行數據檢查，並根據本附註第三點的業務要求對關聯交易報告表進行完整性檢查。
7.對於需要錄入附表1-7的，由於附表1、2、3、4、5、6、7之間存在包含和勾對關系，需要申報系統對填報順序進行監控，即在填報企業關聯交易年度報告表時，應先打開附表1，錄入完成並保存後再錄入附表3、4、5、6。附表2中自動導入的根據表內關系計算的數據不允許修改，附表3至7中根據表內關系計算的數據不允許修改。其余項目可以手工輸入。
8.表體標有“-”的欄目為灰色，不能填寫。