首先，糧食收儲企業高層管理者要真正認識到內部控制的內涵和重要作用，領導層要帶領員工全面增強內部控制意識。同時，培養員工的責任感和價值觀，樹立現代管理理念，增強員工的風險意識和法制觀念。其次，糧食倉儲企業要構建規範的治理結構和議事規則，構建分工和制衡機制。同時，根據企業業務特點和國有企業內控要求，制定管理制度，結合權責落實到各崗位，調動員工積極性，完善內控機制。最後，糧食儲備企業要重視員工素質，建設良好的企業文化，加強員工培訓，制定科學的用人制度，選拔專業的內控人員，為內控機制的完善和實施奠定基礎。
(二)加強內部控制制度的執行
目前，我國大多數糧食收儲企業對內部控制重視不夠，內部控制的相關制度不夠完善，薄弱環節較多，影響了內部控制的實施。造成這種現象的原因是企業不重視內部控制，重管理輕管理的現象仍然普遍存在，影響了內部控制的實施。對此，糧食收儲企業應深刻認識內部控制，設置專業的內部控制機構，實施科學的內部控制制度，為內部控制的實施提供有力保障，促進糧食收儲企業健康運行。
(三)加強企業內部監督
作為內部控制的重點，加強內部監督對促進內部控制的有效性具有重要作用。為了加強內部監督水平，壹是糧食收儲企業要構建完善的內部監督體系，將監督工作滲透到企業的各項管理活動中，充分發揮內部審計的作用，實現企業資產的保值增值。其次，內部控制不應由財務人員擔任，而應配備專業的內部審計人員。企業可以適當提高薪酬，組建內部審計團隊，由企業負責人直接領導，保證內部審計監督的權威性和獨立性，從而充分發揮內部控制制度的完善性，評價其是否得到有效執行，促進內部控制工作的深入開展。最後，加強日常監管和專項監管。前者落實在企業的日常經營管理中。壹旦發現內部控制缺陷，應及時報告並制定解決方案。後者針對內部控制的某些方面，如對儲備糧輪換進行專項監督，既保證了收購糧食的質量和數量，又控制了輪換成本，全面提高了企業的社會效益和經濟效益。