醫學信息工程專業是壹門主要研究醫學信息、信息管理、醫院信息系統等相關的知識和技能，於醫療單位進行醫藥信息系統的開發建設、醫院信息的管理、醫療設備的操作等的專業。
例如：醫院病人信息系統的設計開發、病人病歷檔案的管理、藥品庫存數量的管理、B超等設備的操作等。
醫學信息學專業主幹課程
基礎醫學及臨床類課程：人體解剖學、組織學和胚胎學、細胞生物學、生理學、生物化學、分子生物學、微生物學、免疫學、病理生理學、醫學遺傳學、藥理學、病理學、診斷學、內科學、外科學、婦產科學、兒科學、中醫學、流行病學和循證醫學等。
計算機科學主幹課程：大學計算機基礎、高級程序設計語言（C#語言）、數據庫系統、數據結構、計算機網絡技術、網站建設、信息系統管理、醫院信息系統、醫療決策與支持系統、數據通信、醫學圖像處理、生物信息學、生物醫學主題文獻標引、醫學科技信息檢索等。
衛生管理類課程：管理學基礎與原理、衛生事業管理學、社會醫學、衛生統計學、病案信息管理、衛生信息資源組織、醫學英語、藥事管理學、醫學倫理學、醫藥市場信息、醫藥知識產權、新聞傳播學、圖書編輯與出版、數字圖書館、信息經濟學等。
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