當申請人或代理機構希望在線申請專利時，應首先向專利局提交使用電子申請系統的申請。
根據雙方達成的協議，由專利局頒發用戶代碼和密碼(口令)，稱為電子申請註冊。
現階段只能在專利局申請電子註冊。
2.申請人或代理機構攜帶有效證件，手工填寫並簽署《電子專利申請系統用戶代碼申請表》和《電子專利申請系統用戶註冊協議》。
自然人簽名，單位或公司公章。
面對國家知識產權局，國家知識產權局，在審查上述信息後，將電子申請的用戶代碼分配給用戶。
3.電子申請用戶攜帶個人身份證或身份證原件及復印件給個人；電子申請用戶攜帶本機構的單位介紹信和組織機構代碼證；電子申請用戶為企業，攜帶加蓋企業公章的營業執照復印件。電子申請用戶為專利代理機構，並攜帶加蓋專利代理機構公章的註冊證書復印件。
4.外地個人申請電子註冊時，如不方便來京，可委托他人來京辦理電子申請註冊手續。
但委托人需攜帶註冊人簽署的《電子申請註冊委托書》、註冊人身份證或身份證原件、註冊人簽署的註冊申請表和註冊協議、委托人身份證原件。
5.申請人獲得電子申請的用戶代碼和密碼後，可以使用該用戶代碼和密碼登錄電子申請網站並下載軟件，以獲得電子申請的客戶端軟件。
6.在申請人提出電子專利申請並已被正式受理的情況下，如果專利法及其實施細則和審查指南規定某些文件必須以原件形式(可以是紙質形式或其他有形載體形式)提交，申請人應當通過電子專利申請系統向國家知識產權局提交原件的電子掃描/圖像文本，申請人還應當提交原件。
申請人應當在規定或者指定的期限內提交原件和原物的電子掃描/圖像文本。
如專利委托書、費用減免證明等。