百山祖國家級自然保護區生物多樣性調查（植被、獸類與鳥類部分） 百山祖國家級自然保護區 2010.06-2012.12
千島湖棲息地片段化對鳥類生活史特征的影響 國家自然科學基金 2009.1-2011.12
森林鳥類物種資源監測技術與示範 國家科技支撐計劃專題 2008.1-2011.12
千島湖棲息地片段化對鳥類多樣性和群落聚群格局的影響 國家自然科學基金2007.1-2009.12
丁平、於明堅研究小組 浙江省自然科學基金傑出青年人才項目 2007.1-2009.12
烏巖嶺國家級自然保護區功能區調整可行性研究（鳥類） 浙江烏巖嶺國家級自然保護區管理局 2009-2010
浙江烏溪江濕地公園野生動物資源調查 衢江區林業局 2009-2010
國家濕地公園生態景觀設計技術試驗示範 國家科技支撐計劃子專題 2008-2010
瑞安市紅雙自然保護區生物資源調查 瑞安市林業局 2008
溫州甌江口濕地水鳥生態及其保護對策研究 溫州港城發展有限公司 2007-2008
白頸長尾雉的擴散與棲息地片段化 國家自然科學基金項目 2005
杭州市陸生野生動物資源調查 杭州市林水局重大招標項目2005
西溪國家濕地公園研究 西溪國家濕地公園 2005
鳳陽山自然資源考察與研究 鳳陽山國家級自然保護區 2006
白頸長尾雉不同地理種群的親緣關系及擴散模式研究 國家自然科學基金 2007
SARS冠狀病毒疑似宿主動物（鼬獾）研究 科技部SARS科技專項課題 2005
西湖風景區生物多樣性生態功能研究及保護示範區建設 杭州市科技局 2006
鳳陽山脊椎動物多樣性現狀調查 鳳陽山國家級自然保護區 2005
杭州灣紹興工業新城區生態建設規劃 浙江省環保科學設計研究院 2005
浙江省灘塗圍墾對濕地生態系統的影響與圍墾模式研究 浙江省自然科學基金 2003
白頸長尾雉的生態適應機制及保護對策研究 國家自然科學基金 1999
白頸長尾雉棲息地現狀與種群基因多樣性評估 國家林業局 2005
溫嶺生態市建設規劃 浙江省經濟建設規劃院 2004
甌江灘坑水電站項目生態環境影響評價 國家電力公司華東勘測設計院 2003
浙江省生態環境現狀專題研究 浙江省環境監測中心站 2003
廣西黑葉猴保護生物學和行為生態學 香港嘉道理植物園公司 2004
黑嘴鷗越冬生態與保護對策研究（美國）世界自然基金會（WWF） 2001
鳥類集合群落的空間結構及其穩定性研究 國家自然科學基金 2001
白頸長尾雉棲息地片斷化與保護對策研究 “973”骨幹 2000
浙江珊溪水利樞紐工程對庫區野生動物及其棲息地影響研究 亞洲發展銀行 1996
白頸長尾雉的棲息地選擇與保護對策研究 國家自然科學基金 1994
農田的鼠類越冬生態及冬季滅鼠優化措施的研究 浙江省自然科學基金 1993