2、轉讓方是公司，企業清算或轉讓子公司的全部股權時，被清算或被轉讓企業應按過去已沖銷並調增應納稅所得的壞帳準備等各項資產減值準備的數額，相應調減應納稅所得，增加未分配利潤，轉讓人按享有的權益份額確認為股息性質的所得。
壹、股權轉讓稅費承擔如何計算
(壹)當轉讓方是個人、公司
如果轉讓方是個人，要交納個人所得稅，按照20%繳納。
當轉讓方是公司
如果轉讓方是公司，則需要涉及的稅費較多，內資企業轉讓股權涉及的稅種公司將股權轉讓給某公司，該股權轉讓所得，將涉及到企業所得稅、營業稅、契稅、印花稅等相關問題：
1、企業所得稅
(1)企業在壹般的股權(包括轉讓股票或股份)買賣中，股權轉讓人應分享的被投資方累計未分配利潤或累計盈余公積金應確認為股權轉讓所得，不得確認為股息性質的所得。
(2)企業進行清算或轉讓全資子公司以及持股95%以上的企業時，投資方應分享的被投資方累計未分配利潤和累計盈余公積應確認為投資方股息性質的所得。為避免對稅後利潤重復征稅，影響企業改組活動，在計算投資方的股權轉讓所得時，允許從轉讓收入中減除上述股息性質的所得。
(3)企業已提取減值、跌價或壞帳準備的資產，如果有關準備在申報納稅時已調增應納稅所得，轉讓處置有關資產而沖銷的相關準備應允許作相反的納稅調整。
因此，企業清算或轉讓子公司(或獨立核算的分公司)的全部股權時，被清算或被轉讓企業應按過去已沖銷並調增應納稅所得的壞帳準備等各項資產減值準備的數額，相應調減應納稅所得，增加未分配利潤，轉讓人(或投資方)按享有的權益份額確認為股息性質的所得。
企業股權投資轉讓所得和損失的所得稅處理
(4)企業股權投資轉讓所得或損失是指企業因收回、轉讓或清算處置股權投資的收入減除股權投資成本後的余額。企業股權投資轉讓所得應並入企業的應納稅所得，依法繳納企業所得稅。
(5)企業因收回、轉讓或清算處置股權投資而發生的股權投資損失，可以在稅前扣除，但每壹納稅年度扣除的股權投資損失，不得超過當年實現的股權投資收益和投資轉讓所得，超過部分可無限期向以後納稅年度結轉扣除。
2、營業稅
以無形資產、不動產投資入股，與接受投資方利潤分配，***同承擔投資風險的行為，不征收營業稅。自2003年1月1日起，對股權轉讓不征收營業稅。
3、契稅
根據規定，在股權轉讓中，單位、個人承受企業股權，企業的土地、房屋權屬不發生轉移，不征契稅;在增資擴股中，對以土地、房屋權屬作價入股或作為出資投入企業的，征收契稅。”
4、印花稅股權轉讓的征稅問題
股權轉讓存在兩種情況：壹是在上海、深圳證券交易所交易或托管的企業發生的股權轉讓，對轉讓行為應按證券(股票)交易印花稅3‰的稅率征收證券(股票)交易印花稅。二是不在上海、深圳證券交易所交易或托管的企業發生的股權轉讓，由立據雙方依據協議價格(即所載金額)的萬分之五的稅率計征印花稅。
(二)內資企業股權轉讓的所得稅處理
企業股權投資轉讓所得或損失是指企業因收回、轉讓或清算處置股權投資的收入減除股權投資成本後的余額。企業股權投資轉讓所得應並入企業的應納稅所得，依法繳納企業所得稅。
被投資企業對投資方的分配支付額，如果超過被投資企業的累計未分配利潤和累計盈余公積金而低於投資方的投資成本的，視為投資回收，應沖減投資成本;超過投資成本的部分，視為投資方企業的股權轉讓所得，應並入企業的應納稅所得，依法繳納企業所得稅。
二、股權轉讓有哪些風險
(壹)公司負債風險
股權轉讓合同中，受讓方最關心的應該是目標公司的負債問題。在實踐中，股份出讓方的債務以資產擔保之債居多，同時還存在未決的訴訟和仲裁糾紛，以及知識產權侵權、產品質量侵權責任，以及可能或即將發生的公司與高級管理人員和技術骨幹之間的勞資糾紛等。對於上述既有負債或潛在債務，股份出讓方有的是知道的或應當知道的，有的是不知道或無法預計何時發生的。因此，處理原則和辦法也是不同的。
(二)債務轉讓法律風險
1、既有債務轉讓中的法律風險
受讓人需要全面了解既有債務的數額，是否設定了擔保，利率以違約責任，債權人有無限制權利要求等，此類債務是否為不良債務等。對上述問題的考察，能使受讓人在談判中獲得主動，並影響到交易的價格和受讓後風險負擔的大小，必須予以高度重視。
2、隱性債務轉讓中的法律風險
對於無法預計的負債，如果在股權轉讓協議預定的期限內發生，並且發生實際權利人的追索，該類責任或風險首先應當由目標公司承擔，由此引發的股份轉讓的風險負擔應當由股份轉讓協議約定。因此，有關債務承擔問題應列入風險負擔條款予以約定。受讓方所爭取的是與出讓方劃清責任，要求在正式交割前的所有負債，不管是故意還是過失，均由出讓方承擔。但是要註意到，股權的轉移並不影響到債權人追索的對象，受讓方在成為目標公司股東後，仍然需要清償該債務，再根據股權轉讓合同向出讓方追償。
另壹方面，這也涉及到債權人利益的保護問題。如果股權轉讓導致公司合並或分立，應按照法定的通知時限要求通知有關的債權人，合並或分立後的債務由存續公司承擔或按照協議承擔。
3、隱瞞債務轉讓中的法律風險
對於出讓方故意隱瞞真相，沒有真實、全面、及時地向受讓方批露既有負債或潛在負債的，屬於違反信息批露義務的行為，違反了出讓方有關公司債務的陳述與保證義務。當發生債務追索時，將嚴重影響受讓方的股份轉讓合同的利益和預期的收益。
三、廠房房產證所有人是公司或者個人
寫個人：屬於私人財產，在公司破產清算的時候，這個仍屬於個人的財產，不會被清算公司：屬於公司固定資產，在公司破產清算的時候，法院會對它做出財產保全的。
對於買的時候：寫個人和公司——意義不大，基本上沒有區別
對於賣的時候：
企業所得稅、營業稅、土地增值稅。其中所得和增值是極其可怕的費率很高。
寫個人：營業稅是5個點、（個人按個人所得稅率繳納稅金）所得稅為15%、但目前個人過戶較普遍的是以原登記價，所以無差額可以避稅。
寫企業：營業稅是5個點、（企業按企業所得稅稅率繳納稅金）所得稅為20%、公司物業就避不了；如果寫字樓屬於公司股權的壹部分，轉讓時買賣雙方需要繳納的稅費
四、公司轉讓跟註冊資金有關系嗎
註冊資本的轉讓是合法的，轉讓註冊資金需要納稅。分別需要要繳納以下2種稅：
1、企業所得稅和個人所得稅。依照相關規定，只要是取得了轉讓所得，在扣除必要的購置成本後，如有應納稅所得額應按相關稅率繳納企業所得稅或個人所得稅。如果經扣除後，沒有應納稅所得額，則無需繳納。企業所得稅：正常稅率為25%，優惠稅率為15%；個稅所得稅：股權轉讓個人所得稅稅率為20%。
2、印花稅。非上市公司股權轉讓的印花稅率為立據雙方依據協議價格(即所載金額)的萬分之五的稅率計征印花稅。
五、變更股東需要繳納什麽稅
變更股東需要繳納個人所得稅。
股權轉讓方應當將收益部分的20%繳納個人所得稅。即以轉讓股權的收入額減除原值和合理費用後的余額，適用百分之二十的比例稅率，計算繳納個人所得稅。
個人所得稅不少納稅人、扣繳義務人對於股權轉讓環節可能涉及個人所得稅納稅義務認識較為片面，以為只要自然人股東采取平價或低價形式轉讓股權，便沒有所得，無須申報繳納或扣繳個人所得稅，甚至有的受讓人不知道在向轉讓人、原自然人股東、支付股權轉讓款項時有扣繳其個人所得稅的義務，從而給征納雙方增加不必要的成本、損失。現就相關政策作壹梳理。應納稅所得額的計算。
財產轉讓所得按照壹次轉讓財產的收入額減除財產原值和合理費用後的余額，作為應納稅所得額。壹、股權轉讓稅費承擔如何計算
(壹)當轉讓方是個人、公司
如果轉讓方是個人，要交納個人所得稅，按照20%繳納。
當轉讓方是公司
如果轉讓方是公司，則需要涉及的稅費較多，內資企業轉讓股權涉及的稅種公司將股權轉讓給某公司，該股權轉讓所得，將涉及到企業所得稅、營業稅、契稅、印花稅等相關問題：
1、企業所得稅
(1)企業在壹般的股權(包括轉讓股票或股份)買賣中，股權轉讓人應分享的被投資方累計未分配利潤或累計盈余公積金應確認為股權轉讓所得，不得確認為股息性質的所得。
(2)企業進行清算或轉讓全資子公司以及持股95%以上的企業時，投資方應分享的被投資方累計未分配利潤和累計盈余公積應確認為投資方股息性質的所得。為避免對稅後利潤重復征稅，影響企業改組活動，在計算投資方的股權轉讓所得時，允許從轉讓收入中減除上述股息性質的所得。
(3)企業已提取減值、跌價或壞帳準備的資產，如果有關準備在申報納稅時已調增應納稅所得，轉讓處置有關資產而沖銷的相關準備應允許作相反的納稅調整。
因此，企業清算或轉讓子公司(或獨立核算的分公司)的全部股權時，被清算或被轉讓企業應按過去已沖銷並調增應納稅所得的壞帳準備等各項資產減值準備的數額，相應調減應納稅所得，增加未分配利潤，轉讓人(或投資方)按享有的權益份額確認為股息性質的所得。
企業股權投資轉讓所得和損失的所得稅處理
(4)企業股權投資轉讓所得或損失是指企業因收回、轉讓或清算處置股權投資的收入減除股權投資成本後的余額。企業股權投資轉讓所得應並入企業的應納稅所得，依法繳納企業所得稅。
(5)企業因收回、轉讓或清算處置股權投資而發生的股權投資損失，可以在稅前扣除，但每壹納稅年度扣除的股權投資損失，不得超過當年實現的股權投資收益和投資轉讓所得，超過部分可無限期向以後納稅年度結轉扣除。
2、營業稅
以無形資產、不動產投資入股，與接受投資方利潤分配，***同承擔投資風險的行為，不征收營業稅。自2003年1月1日起，對股權轉讓不征收營業稅。
3、契稅
根據規定，在股權轉讓中，單位、個人承受企業股權，企業的土地、房屋權屬不發生轉移，不征契稅;在增資擴股中，對以土地、房屋權屬作價入股或作為出資投入企業的，征收契稅。”
4、印花稅股權轉讓的征稅問題
股權轉讓存在兩種情況：壹是在上海、深圳證券交易所交易或托管的企業發生的股權轉讓，對轉讓行為應按證券(股票)交易印花稅3‰的稅率征收證券(股票)交易印花稅。二是不在上海、深圳證券交易所交易或托管的企業發生的股權轉讓，由立據雙方依據協議價格(即所載金額)的萬分之五的稅率計征印花稅。
(二)內資企業股權轉讓的所得稅處理
企業股權投資轉讓所得或損失是指企業因收回、轉讓或清算處置股權投資的收入減除股權投資成本後的余額。企業股權投資轉讓所得應並入企業的應納稅所得，依法繳納企業所得稅。
被投資企業對投資方的分配支付額，如果超過被投資企業的累計未分配利潤和累計盈余公積金而低於投資方的投資成本的，視為投資回收，應沖減投資成本;超過投資成本的部分，視為投資方企業的股權轉讓所得，應並入企業的應納稅所得，依法繳納企業所得稅。
六、股權轉讓有哪些風險
(壹)公司負債風險
股權轉讓合同中，受讓方最關心的應該是目標公司的負債問題。在實踐中，股份出讓方的債務以資產擔保之債居多，同時還存在未決的訴訟和仲裁糾紛，以及知識產權侵權、產品質量侵權責任，以及可能或即將發生的公司與高級管理人員和技術骨幹之間的勞資糾紛等。對於上述既有負債或潛在債務，股份出讓方有的是知道的或應當知道的，有的是不知道或無法預計何時發生的。因此，處理原則和辦法也是不同的。
(二)債務轉讓法律風險
1、既有債務轉讓中的法律風險
受讓人需要全面了解既有債務的數額，是否設定了擔保，利率以違約責任，債權人有無限制權利要求等，此類債務是否為不良債務等。對上述問題的考察，能使受讓人在談判中獲得主動，並影響到交易的價格和受讓後風險負擔的大小，必須予以高度重視。
2、隱性債務轉讓中的法律風險
對於無法預計的負債，如果在股權轉讓協議預定的期限內發生，並且發生實際權利人的追索，該類責任或風險首先應當由目標公司承擔，由此引發的股份轉讓的風險負擔應當由股份轉讓協議約定。因此，有關債務承擔問題應列入風險負擔條款予以約定。受讓方所爭取的是與出讓方劃清責任，要求在正式交割前的所有負債，不管是故意還是過失，均由出讓方承擔。但是要註意到，股權的轉移並不影響到債權人追索的對象，受讓方在成為目標公司股東後，仍然需要清償該債務，再根據股權轉讓合同向出讓方追償。
另壹方面，這也涉及到債權人利益的保護問題。如果股權轉讓導致公司合並或分立，應按照法定的通知時限要求通知有關的債權人，合並或分立後的債務由存續公司承擔或按照協議承擔。
3、隱瞞債務轉讓中的法律風險
對於出讓方故意隱瞞真相，沒有真實、全面、及時地向受讓方批露既有負債或潛在負債的，屬於違反信息批露義務的行為，違反了出讓方有關公司債務的陳述與保證義務。當發生債務追索時，將嚴重影響受讓方的股份轉讓合同的利益和預期的收益。
法律依據
《國家稅務總局關於非居民企業股權轉讓適用特殊性稅務處理有關問題的公告》
六、非居民企業發生股權轉讓屬於《通知》第七條第（二）項情形的，應區分以下兩種情形予以處理：
（壹）受讓方和被轉讓企業在同壹省且同屬國稅機關或地稅機關管轄的，按照本公告第五條規定執行。
（二）受讓方和被轉讓企業不在同壹省或分別由國稅機關和地稅機關管轄的，受讓方所在地省稅務機關收到主管稅務機關意見後30日內，應向被轉讓企業所在地省稅務機關發出《非居民企業股權轉讓適用特殊性稅務處理告知函》（見附件2）。
七、非居民企業股權轉讓適用特殊性稅務處理備案後經調查核實不符合條件的，應調整適用壹般性稅務處理，按照有關規定繳納企業所得稅。非居民企業股權轉讓適用特殊性稅務處理未進行備案的，稅務機關應告知其按照本公告第二條、第三條的規定辦理備案手續。
八、非居民企業發生股權轉讓屬於《通知》第七條第（壹）項情形且選擇特殊性稅務處理的，轉讓方和受讓方不在同壹國家或地區的，若被轉讓企業股權轉讓前的未分配利潤在轉讓後分配給受讓方的，不享受受讓方所在國家（地區）與中國簽訂的稅收協定（含稅收安排）的股息減稅優惠待遇，並由被轉讓企業按稅法相關規定代扣代繳企業所得稅，到其所在地所得稅主管稅務機關申報繳納。