其次，要考慮妳開發的軟件是不是職務作品。根據著作權法第十六條規定，“公民完成法人或者其他組織的任務所創作的作品，屬於職務作品。除本條第二款規定外，著作權屬於作者，但法人或者其他組織有權在其業務範圍內優先使用。作品完成後兩年內，未經單位同意，作者不得許可第三人以與單位使用作品相同的方式使用該作品。
有下列情形之壹的，作者享有署名權，著作權的其他權利由法人或者其他組織享有，法人或者其他組織可以對作者給予獎勵:
(壹)主要利用法人或者其他組織的物質技術條件創作的，由法人或者其他組織負責的工程設計圖、產品設計圖、地圖、計算機軟件等職務作品；
(二)擔任法律、行政法規規定或者合同約定由法人或者其他組織享有著作權的職務。“也就是看妳的軟件開發是否主要基於妳公司提供的物質技術條件(比如公司提供的資金、設備、材料)，開發的軟件由他們負責。如果是，屬於職務工作，妳有權利要求壹定的報酬。
更詳細的看我國《計算機軟件保護條例》第十三條。“自然人在法人或者其他組織任職期間所開發的軟件有下列情形之壹的，軟件著作權由法人或者其他組織享有，法人或者其他組織可以對開發該軟件的自然人給予獎勵:
(1)根據工作中明確規定的開發目標開發的軟件；
(2)所開發的軟件是從事自己工作活動的可預見結果或自然結果；
(三)主要利用法人或者其他組織的資金、專用設備、未公開的專門信息等物質技術條件開發的，由法人或者其他組織負責的軟件。"
至於申請專利，如果屬於職務作品，根據我國專利法的規定，妳公司有權取得職務發明創造專利權，向知識產權局申請專利。