菌種選擇方面：菌種分液體與固體，可在養殖業中直接運用和發酵成生物飼料。生物活性飼料是壹個生態工程原理，采用好氧與厭氧結合的發酵工藝，以光合細菌，乳酸菌，酵母菌，放線菌等有益微生物組成。以餅粕，糠麩，玉米，等為主要原料，經粉碎混合發酵而成，可以用微生態制劑，也可以用袋裝的活菌幹粉。
目前市場上的菌種產品五花八門。別特別是em菌，真的假的真真假假，壹般用戶很難辨別。真正日本授權的em菌的生產廠家只有3~4個，南京，江西，廣州都有生產廠家。本試驗場簡單介紹壹下目前市場上的壹些產品，但要聲明的是本試驗場不是賣廣告，誠心為同行業者著想（特別是不要購買被人家擴繁多次的em菌）。1，日本系列的有em菌，酵素菌。2，國產的有活力99，天津科大的高活性稭稈發酵劑。還有神微（號稱中國em），種植和環保用的是晟微。神微和晟微是由中國農業大學教授李維炯夫婦研制出了的，具有完全知識產權。但菌種要提前加紅糖復活，如果青貯的話添加食鹽0.2%~0.5%,有利於乳酸菌發酵，還可以破壞某些病毒。（以下介紹兩個較有代表性的菌種----日本的EM和國產的EM，國產em名叫神微）
主要技術指標
壹，厭氧發酵：
1，酸堿度：PH值6.5到7左右，蛋白質，氨基酸分別提高10%左右。
2.，發酵時間：3 ~5d（視溫度而定）
3，發酵溫度：25~<?XML:NAMESPACE PREFIX = ST1 />30°C。
二，有氧發酵：
1，溫度：25~35°C。有氧發酵溫度容易升高，但高於40°時，要及時反動飼料。
2，飛機時間：24~28h。
3，質量標準：濃郁的飛機型酸甜味，色澤較深，表面有均勻的白色短菌絲分布。
原料配比：
1000公斤飼料+350公斤水+1~2公斤菌劑，1~2公斤紅糖。飼料是壹般的粉狀飼料，其中不要有抗生素，激素，抗菌藥。水最好用井水，如自來水要放24小時後再用。
厭氧發酵：（大部分用厭氧發酵）
將接種後的飼料裝入塑料袋或缸內，充分壓實後密封發酵（註意不要有漏氣）。