在法人治理結構方面，股東會、董事會、監事會、經理層之間應形成權責分配、激勵與約束、權利制衡關系，把各項管理落到實處。在管理部門設置方面，建立完善科學的、符合企業特點的內部組織結構，合理、有效地設置各部門和崗位，建立部門和崗位責任制度，明確工作職責，建立、健全內部牽制制度，實行不相容職務相分離。根據內部控制的要求，單位在確定和完善組織結構的過程中，應當遵循不相容職務分離的原則。單位的經濟活動通常可以劃分為五個步驟，即：授權、簽發、核準、執行和記錄。壹般情況下，如果上述每壹步驟由相對獨立的人員（或部門）實施，就能夠保證不相容職務的分離，便於內部控制作用的發揮。
二、規範財務會計核算，全面推行預算管理
企業必須依據會計法和國家統壹的會計制度等法規，制定適合本企業的會計處理程序，實行會計人員崗位責任制，建立嚴密的會計控制系統。在實行國家統壹的壹級會計科目的基礎上，企業應根據經營管理需要，統壹設定明細科目，集團性公司更有必要統壹下級公司的會計明細科目，以便統壹口徑，統壹核算。明確會計憑證、會計賬薄和財務會計報告的處理程序與方法，遵循會計制度規定的核算原則，使會計真正實現為國家宏觀經濟調控和管理提供信息、為企業內部經營管理提供信息、為企業外部各有關方面了解其財務狀況和經營成果提供信息的目標。
預算是企業財務管理的重要組成部分，它是為達到企業既定目標編制的經營、資本、財務等年度收支總體計劃，包括籌資、融資、采購、生產、銷售、投資、管理等經營活動的全過程。要以營業收入、成本費用、現金流量為重點推行全面預算管理，並對預算結果及時進行科學分析，對產生的差異進行有效控制。
三、健全財產保全制度，防範市場經營風險
嚴格執行財產保全控制，限制未授權人員對財產直接接觸，並采取定期盤點、賬實核對、記錄保護、財產保險、記錄監控等措施，確保各種財產的安全完整。
樹立風險意識，針對各個風險控制點建立有效的風險管理系統，通過風險的預警、識別、評估、分析、報告等措施，對財務風險和經營風險進行全面防範和控制。必要時可設置風險評估部門或崗位，專門負責有關風險的識別、規避和控制。
四、完善用人制度，加強信息管理
人力資源要素的數量和質量狀況，人力資源所具有的忠誠、向心力和創造力，是企業興旺發達的活力和強大推動力所在。因此，如何充分調動企業人力資源的積極性、主動性、創造性，發揮人力資源的潛能，已成為企業管理的中心任務。人力資源控制應建立嚴格的招聘程序，保證應聘人員符合招聘要求。要定期對員工進行培訓，提高其業務素質以更好地完成規定的任務；加強對職工業績考核，調動職工工作的積極性和創造性。
五、建立內部報告制度，完善內部審計體制
為滿足企業內部管理的時效性和針對性，企業應當建立內部管理報告體系，借助管理會計手段，如實反映經營狀況，及時披露相關重要信息。
內部審計控制是內部控制的壹種特殊形式，這是壹個企業內部經濟活動和管理制度是否合規、合理和有效的獨立評價機構，在某種意義上講是對其他內部控制的再控制。內部審計在企業應保持相對獨立性，應獨立於其他經營管理部門，最好受董事會或下屬的審計委員會領導。內審部門負責審查各項內部控制制度的執行情況，並將審查結果向企業董事會或最高管理當局報告。內部審計工作越仔細，內部控制制度越健全，越能增強內部控制工作的效率與可靠性