實行“壹照壹碼”登記的市場主體註銷時，需先進行清稅申報，向稅務機關填報《清稅申報表》，稅務機關在結清應納稅款、多退(免)稅款、滯納金和罰款，繳銷發票和相關證件後，向納稅人出具《清稅證明》。
網上辦理流程：
1.納稅人已通過電子稅務局提交資料，稅務人員通過稅源管理平臺查閱相關資料;按照以下情況分別辦理：(1)納稅人提交資料齊全、符合法定形式的，受理申請。(2)納稅人提交資料不齊全或不符合法定形式的，制作《稅務事項通知書》(補正通知)，壹次性告知納稅人需補正的內容。(3)依法不屬於本機關職權或本業務受理範圍的，制作《稅務事項通知書》(不予受理通知)，告知納稅人不予受理的原因。
2.辦稅服務廳人員出具清稅證明
(1)納稅人已辦結所有稅務事項的，出具《清稅證明》;
(2)納稅人存在以下情形的，通知其存在未結事宜：
①納稅人存在未申報、欠稅信息;
②納稅人存在未驗舊的發票;
③土地增值稅納稅人未完成土地增值稅清算;
④企業所得稅納稅人未完成企業所得稅清算;
⑤納稅人存在多繳(包括預繳、應退未退)稅款;
⑥納稅人存在未結報的稅收票證;
⑦納稅人存在其他應結未結事項。
3. 稅務機關確認納稅人結清應納稅款、多退(免)稅款、滯納金和罰款，繳銷發票和相關證件後，向納稅人出具《清稅證明》，提示其憑稅務機關開具的《清稅證明》辦理工商登記註銷。