認定條件不同
1、主要從事生產或提供應稅勞務(特指加工、修理修配勞務)的：年銷售額在100萬元以上的，可以認定為壹般納稅人，100萬以下的為小規模;
2、主要從事貨物批發零售的：年銷售額180萬以上的可以認定為壹般納稅人，180萬以下為小規模。工業企業年銷售額在100萬以下的,商品流通企業年銷售額在180萬以下的,屬於小規模納稅人;反之，為壹般納稅人。
帳務處理上區別
(壹)在購買商品時，如果對方開具增值稅發票，兩者處理存在不同
1、壹般納稅人處理為
借 庫存商品等
借 應交稅金-應交增值稅(進項稅額)
貸 銀行存款等
2、小規模納稅人為
借 庫存商品等
貸 銀行存款等
小規模納稅人不能抵扣進項稅。
(二)在銷售商品時，采用的稅率不同。
1、壹般納稅人：
借：銀行存款(或應收賬款)
貸：主營業務收入
貸：應交稅金--應交增值稅(銷項稅額)
2、小規模納稅人：
借：銀行存款(或應收賬款)
貸：主營業務收入
貸：應交稅金--應交增值稅
稅收管理規定的區別
1、壹般納稅人：銷售貨物或提供應稅勞務可以開具增值稅專用發票;購進貨物或應稅勞務可以作為當期進項稅抵扣;計算方法為銷項減進項。
2、小規模納稅人：只能使用普通發票;購進貨物或應稅勞務即使取得了增值稅專用發票也不能抵扣;計算方法為銷售額×征收率。
稅率與征收率不同
1、壹般納稅人：基本稅率17%，稅法還列舉了5類適應13%低稅率的貨物，還有幾項特殊業務按簡易辦法征收(參照小規模)。還有零稅率應稅勞務和貨物。
2、小規模納稅人：商業小規模按4%征收率;商業以為小規模按6%，(免稅的除外)。