壹般情況下申辦農民專業合作社，***涉及工商、公安、稅務、質監、銀行 農業等多個部門。
首先：工商行政管理局設立登記， 提交材料：1、設立登記申請書;2、全體設立人簽名、蓋章的設立大會紀要;3、全體設立人簽名、蓋章的章程;4、法定代表人、理事的任職文件和身份證明;5、全體出資成員簽名、蓋章予以確認的出資清單;6、法定代表人簽署的成員名冊和成員身份證明復印件;7、住所使用證明;8、指定代表或者委托代理人的證明;9、合作社名稱預先核準申請書;10、業務範圍涉及前置許可的文件。不收任何費用。
第二：公安局制定刻章 ， 提交材料：合作社法人營業執照復印件、法人代表身份證復印件、經辦人身份證復印件。 收費400元上下。
第三：質量技術監督局辦理組織機構代碼證 ， 提交材料：1、合作社法人營業執照副本原件及復印件壹份;2、合作社法人代表及經辦人身份證原件及復印件壹份;3、如受他人委托代辦的，須持有委托單位出具的代辦委托書面證明。 收費內容：108元/證，工本費：正本每份10元，副本每份8元;技術服務費90元。
第四：國家、地方稅務局申領稅務登記證 ， 提交材料：1、法人營業執照副本及復印件;2、組織機構統壹代碼證書副本及復印件;3、法定代表人(負責人)居民身份證或者其他證明身份的合法證件復印件;4、經營場所房屋產權證書復印件;5、成立章程或協議書復印件。免收稅務登記工本費。
第五：辦理銀行開戶和賬號 ， 提交材料：1、法人營業執照正、副本及其復印件;2、組織機構代碼證書正、副本及其復印件;3、農民專業合作社法定代表人的身份證及其復印件;4、經辦人員身份證明原件、相關授權文件;5、稅務登記證正、副本及其復印件;6、合作社公章和財務專用章及其法人代表名章。不收費 。
第六：當地農經主管部門備案，提交材料：1、法人營業執照復印件;2、組織機構代碼證書復印件;3、農民專業合作社法定代表人的身份證復印件;4、稅務登記證正、副本復印件。