(1)本單位業務需要，沒有對外費用結算的非經營性業務。
(2)單位主營業務需要對外進行費用結算的非社會經營業務。
(三)面向社會的社會商業服務。第五條專用碼頭單位從事經營活動(包括對外貿船舶開放)，必須向上海港務局提出申請，經其上級主管部門同意。上海港務局和上海海事局根據各自的職責，對申請進行審批，發給營業執照，然後向工商行政管理部門申請工商登記。
專用碼頭單位擴大使用能力或改變用途，必須按照上述規定辦理變更登記手續。
營業執照有效期為1年。第六條專用碼頭單位所有的港口設施產權或者經營權發生變更時，應當向港口管理處辦理登記手續。
需要使用本單位的港口設施與其他單位或外商聯合經營的，應按規定報有關部門批準，合同應報港航管理處備案。第七條專用碼頭單位從事裝卸、倉儲等業務，必須遵守國家和本市的法律、法規和規章，以及上海港務局制定的裝卸、倉儲和安全作業操作規程。第八條從事對外貿易運輸和本單位主營業務需要結算的裝卸、倉儲等非社會經營性業務的專用碼頭單位，必須按照國家規定的費率標準收費。從事社會國內運輸業務的費率可參照交通部和地方有關部門的收費標準在壹定範圍內浮動，但執行的費率應報上海港務局批準，並報市物價局備案。第九條停靠專用碼頭的外貿船舶應當按照有關規定申報。專用碼頭單位應當將停靠專用碼頭的外貿船舶貨物動態報口岸管理辦公室備案。第十條從事社會經營的專用碼頭單位應優先安排市政府下達的疏港任務。第十壹條專用碼頭單位必須按照國家和本市的有關規定收取貨物港口費、港口建設費等運輸費用。第十二條專用碼頭單位應定期向港口管理處報送《企業(單位)專用碼頭基本信息表》、《企業(單位)專用碼頭船舶、貨物進出清單》等統計報表。第十三條專用碼頭單位從事裝卸、倉儲等業務，對外費用結算，必須使用市稅務局印制的上海港專用碼頭統壹發票。
除短途駁運和渡運零星貨物外，雙方均可即時結算。專用碼頭單位在辦理貨物承運和托運手續時，應使用國家統壹規定的水路貨物運單。沒有貨物運單，不允許裝卸貨物。第十四條從事社會運輸業務的專業碼頭單位完成企業合同上交利潤任務後，按規定納稅後的凈收入，轉入技術改造專項基金；未承包經營、從事社會運輸業務的專用碼頭單位的凈收入，免征調節稅。稅後利潤的壹部分由專用碼頭單位按規定分配，主要用於改善碼頭的裝卸和倉儲條件。第十五條專用碼頭單位參加社會營業的所有職工，完成主管部門核定的定額後，人均按日發給津貼。這項津貼計入成本，不計入工資基金。各單位因從事社會業務提取的津貼，應按規定報香港管理處審批，並報財稅部門備案。
個人津貼標準由市勞動局會同上海港務局另行制定。第十六條專用碼頭單位可從社會業務外匯收入中提取50%，主要用於碼頭設施的建設和改造。
從事社會業務的專用碼頭單位收取的貨物港口費，應當預留80%用於碼頭的建設和改造；20%給港口管理處用於疏浚主航道。第十七條從事非社會業務的專用碼頭單位，按營業額的0.5%向香港管理處繳納管理費，從事社會業務的，按營業額的3%向香港管理處繳納管理費。