物流方面：主要核實貨物的來龍去脈，貨物什麽時候什麽地點出庫，由什麽人運輸什麽時間到達什麽地點，由什麽人接受等。
票流方面：開票方是誰，什麽時候開具，受票方是水，什麽時候認證，有沒有對應的其他發票，例如運輸發票。
資金流方面：采取什麽支付方式，什麽時候支付，支付金額多少，由什麽人收取，有無相關的支付手續。
但實際上檢查虛開發票存在許多難點。取證難，取證要求嚴格，但是對虛開發票的處罰是非常嚴重的。
壹、專項檢查的範圍和內容
（壹）檢查範圍
對2016年5月1日全面推開營改增試點以來，納稅人發票使用情況（重點是生活服務業和商業零售業納稅人），以及國稅機關代開發票、發放發票、繳銷發票情況開展專項檢查。
（二）檢查內容
1.納稅人發票開具是否規範
納稅人銷售貨物、勞務、服務、無形資產或不動產，是否以各種理由拒絕開票；是否違反規定要求購買方額外提供證件證明導致開票難；是否隨意變更品名等錯開票；納稅人開具增值稅電子普通發票，購買方當場索取紙質普通發票的，納稅人是否提供。
2.稅務機關代開發票是否規範
稅務機關是否嚴格按照納稅服務規範代開發票，是否額外要求納稅人提供相關證件或其他證明材料，是否審核納稅人申請代開發票內容超經營範圍。
3.稅務機關發票發放及繳銷是否規範
稅務機關是否根據納稅人生產經營和發票使用的實際情況，合理發放發票，滿足納稅人生產經營的合理需求。稅務機關是否嚴格按照《國家稅務總局關於進壹步加強營改增後國稅、地稅發票管理銜接工作的通知》(稅總函〔2016〕192號)規定的期限，及時對地稅機關已發放的發票進行繳銷。
4.稅務機關對納稅人的宣傳輔導是否到位
稅務機關是否大力宣傳營改增相關稅收政策，強化對納稅人關於發票領用、開具、保管相關制度規範的宣傳，消除社會上對增值稅發票開具方面的誤解。
5.稅務機關是否及時處理消費者有關發票的投訴舉報。