工資、薪金所得應繳納的個人所得稅可以由納稅人直接繳納，也可以由扣繳義務人扣繳。從2006年1月1日起，它以納稅人每月取得的工資薪金收入扣除1600元（或4000元）後的余額為應稅所得，根據九級超額累進稅率，計算其應納所得稅額。
例：某外商投資企業的中方財務經理2006年12月月薪收入3000元，2006年度壹次性獎金30000元。該經理12月份應繳納的個人所得稅計算如下：
①12月份工資收入應納個人所得稅：
（3000－1600）×10%－25=115（元）
②l2月份取得的年終獎應納個人所得稅：
30000÷12=2500（元）
先確定適用稅率為l5%，速算扣除數為l25。
30000×15%－l25＝4375（元）
③l2月份應繳個人所得稅合計：
115＋4375＝4490（元）
2.勞務報酬所得應納所得稅的計算
勞務報酬所得個人所得稅應納稅額的計算公式為：
（1）每次收入不足4000元的：
應納稅額=應納稅所得額×適用稅率=（每次收入額－800）×20%
（2）每次收入在4000元以上的：
應納稅額=應納稅所得額×適用稅率=每次收入額×（1－20%）×20%
（3）每次收人超過20000元的：
應納稅額=應納稅所得額×適用稅率－速算扣除數＝每次收入額×（1—20%）×適用稅率－速算扣除數
值得註意的是，對勞務報酬所得壹次收入畸高，即個人壹次取得的應納稅所得額超過20000元至50000元部分，依稅法規定計算應納稅額後再按照應納稅額加征五成，超過50000元的部分，加征十成。
例:2006年8月歌星劉某應邀參加C公司慶典活動的演出。按照協議劉某演出四場，每場出場費為l5000元。劉某演出收入應納個人所得稅為：
應稅所得額=15000×4×（1－20%）=48000（元）
應納稅額=48000×30%－2000=12400（元）
3.在中國境內無住所的個人未滿壹月工資薪金所得應納稅額的計算
例：加拿大某公司派某技術人員2007年到我國某通訊公司安裝調試通訊設備，該外籍人員1－4月在華工作，其中4月份僅在我國居住15天。其工資由加拿大通訊設備公司支付，日薪折合人民幣2000元，4月份應納的個人所得稅是多少？
月薪＝2000×30天＝60000（元）
應納稅額＝［（60000－4800）×30%－3375］×15÷30＝6592.5（元）
4.境外所得的已納稅款的扣除
根據《個人所得稅法》規定，納稅義務人從中國境外取得的所得，準予其在應納稅額中扣除已在境外繳納的個人所得稅稅款。但扣除額不得超過該納稅義務人境外所得依照我國稅法規定計算的應納稅額。
5.個人獨資企業和合夥企業投資者個人所得稅的計算
（1）投資者的工資不得在稅前扣除。自2006年1月1日起投資者的費用扣除標準為19200元/年。
（2）企業從業人員的工資支出按標準在稅前扣除，具體標準由各省、自治區、直轄市地方稅務局參照企業所得稅計稅工資標準確定。
（3）投資者及其家庭發生的生活費用不允許在稅前扣除。投資者及其家庭發生的生活費用與企業生產經營費用混合在壹起，並且難以劃分的，全部視為投資者個人及其家庭發生的生活費用，不允許在稅前扣除。
（4）企業生產經營和投資者及其家庭生活***用的固定資產，難以劃分的，由主管稅務機關根據企業的生產經營類型、規模等具體情況，核定準予在稅前扣除的折舊費用的數額或比例。 考試大為妳加油
（5）企業實際發生的工會經費、職工福利費、職工教育經費分別在其計稅工資總額的2%、l4%、15%的標準內據實扣除。
（6）企業每壹納稅年度發生的廣告和業務宣傳費用不超過當年銷售（營業）收入2%的部分，可據實扣除；超過部分可無限期向以後納稅年度結轉。
（7）企業每壹納稅年度發生的與其生產經營業務直接相關的業務招待費，在以下規定比例範圍內，可據實扣除：全年銷售（營業）收人凈額在1500萬元及其以下的，不超過銷售（營業）收入凈額的5%a；全年銷售（營業）收入凈額超過l500萬元的，不超過該部分的3‰。
（8）企業計提的各種準備金不得扣除。（壞賬準備也不得扣除）
有下列情形之壹的，則采取核定征收方式征收個人所得稅：
（1）企業依照國家有關規定應當設置但未設置賬簿的；
（2）企業雖設置賬簿，但賬目混亂或者成本資料、收人憑證、費用憑證殘缺不全，難以查賬的；
（3）納稅人發生納稅義務，未按照規定期限辦理納稅申報，經稅務機關責令限期申報，逾期仍不申報的。
實行核定應稅所得率征收方式的，應納所得稅額的計算公式如下：
應納所得稅額＝應納稅所得額×適用稅率
應納稅所得額＝收入總額×應稅所得率
或=成本費用支出額÷（1－應稅所得率）×應稅所得率