企業在法院結案後的訴訟費，只要具備了法院開具的《人民法院訴訟費用專用票據》，在年度清算時填寫在資產損失稅前扣除及納稅調整明細表，同時須經稅務機關備案審批後，就可以直接在稅前扣除了。
允許抵扣的進項稅額包括：
1。從銷售方取得的增值稅專用發票上註明的增值稅額；
2。從海關取得的完稅憑證上註明的增值稅額；
3。購進免稅農業產品，按照買價和13%的扣除率計算的進項稅額；
4。外購貨物(固定資產除外)和銷售貨物所支付的運費，依7%的扣除率計算的進項稅額；
5。生產企業壹般納稅人購入廢舊物資經營單位銷售的廢舊物資，可按廢舊物資單位開具的普通發票上註明的金額，依10%的扣除率計算的進項稅額。
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法律依據：《企業所得稅法》第三十七條
對非居民企業取得本法第三條第三款規定的所得應繳納的所得稅，實行源泉扣繳，以支付人為扣繳義務人。稅款由扣繳義務人在每次支付或者到期應支付時，從支付或者到期應支付的款項中扣繳。
第三十九條
依照本法第三十七條、第三十八條規定應當扣繳的所得稅，扣繳義務人未依法扣繳或者無法履行扣繳義務的，由納稅人在所得發生地繳納。納稅人未依法繳納的，稅務機關可以從該納稅人在中國境內其他收入項目的支付人應付的款項中，追繳該納稅人的應納稅款。