西安市地方稅務局為省地方稅務局的直屬機構。根據主要職責，西安市地方稅務局設11個內設機構：
（1）辦公室
負責起草和審核市局重要文稿；負責機關文電、機要、會務、檔案、督辦、信訪、保密等工作；負責稅收宣傳、政務公開、政府信息公開、信息報道和新聞發布工作；負責機關財務管理、政府采購、資產管理、公務接待等其他行政事務；組織辦理人大代表議案、建議和政協委員提案的有關事項。
（2）政治部
負責機關和系統的幹部人事、機構編制、教育培訓、工資管理、專業技術職務和公務員管理工作；負責下壹級領導班子及領導幹部的管理、考核及監督等工作；負責本系統基層建設；組織實施機關和本系統目標責任考核和獎懲工作；負責離退休人員的管理；負責市局黨委日常工作，承辦領導交辦的其他工作。
（3）政策法規處
擬訂並組織實施本系統依法行政、依法治稅工作方案；組織協調涉及多稅種、綜合性稅收政策的落實工作；組織開展綜合性稅收政策調研；承擔本級地稅機關有關規範性文件的合法性審核工作；負責對稅收法律法規、規章及規範性文件執行情況的監督檢查；牽頭重大稅收案件審理及規範稅務行政審批工作；辦理稅務行政處罰聽證、行政復議和行政應訴；參與有關納稅輔導、咨詢服務、稅收法律救濟工作。
（4）征管和科技發展處
負責稅收征管法及其實施細則在本系統的貫徹實施，組織落實稅收征管規範性文件；負責綜合性稅源管理，組織實施納稅評估管理工作；組織實施稅收信用體系建設；負責地方稅務登記、稅收發票、賬簿、憑證、納稅申報和稅收資料管理；負責征管質量考核；擬訂本系統稅收管理信息化的總體規劃，承辦稅收管理信息化建設中業務需求整合和流程優化的綜合協調管理工作。
（5）流轉稅處
組織實施營業稅、城市維護建設稅、教育費附加等稅種的征收管理工作，擬訂征收管理具體實施辦法；對有關稅種的具體業務政策和問題進行調研、解釋和處理；指導有關稅種的日常管理和檢查；依法辦理減免稅有關事項；負責指導、協調和檢查有關稅收法律法規和國家（地區）間稅收協議、協定（安排）的執行；負責非居民稅收管理；研究擬訂反避稅管理的規範性文件和操作規程；指導全市關聯申報工作，組織實施特別納稅調整工作；組織市內區域、行業聯查和大型跨國公司的反避稅檢查，參與全省反避稅聯查；組織實施全市重大反避稅案件的調查工作。
（6）所得稅處
組織實施企業所得稅、個人所得稅的征收管理工作，擬訂具體征收管理實施辦法；組織實施所得稅匯算清繳、納稅評估、分類管理工作；指導所得稅的日常管理和檢查；依法辦理有關稅前扣除和減免稅事項；參與有關納稅輔導、咨詢服務、稅收法律救濟工作。
（7）財產和行為稅處
組織實施資源稅、車船稅、房產稅、城鎮土地使用稅、印花稅、土地增值稅、契稅、耕地占用稅、煙葉稅等稅收業務管理，擬訂征收管理具體實施辦法；對有關稅種的具體業務政策和問題進行調研、解釋和處理；指導有關稅種的日常管理和檢查；依照稅法規定辦理有關稅收減免的具體事項。
（8）基金處
負責省、市政府決定由地稅機關征收的社會保險費及各類基金的征收管理工作，制定有關征管制度及實施細則；負責本系統保險費及基金的計劃編制和任務下達，對計劃執行情況進行監督檢查；負責系統社保費和各項基金收入預測、統計和分析，編制社保費和基金收入報表；配合財務部門計算、兌付社保費和基金勞務費。
（9）稅源處
負責本系統稅收計劃的編制和任務分配；負責稅收會計和稅收票證管理工作；負責本系統地方稅收數據管理、統計分析評價，編制地方稅收會計、統計報表；負責對地方稅重點稅源的監控，稅源資料的調查和測算；開展稅收能力評估和稅收宏觀分析；組織對稅收政策執行結果的分析研究。
（10）財務和審計處
負責本系統經費、財務、基本建設、國有資產和政府采購 工作；落實地方稅務系統財務制度，監督檢查各項財經法律法 規和制度執行情況；審核匯編本系統的財務預算、決算，辦理 各項經費劃撥；承擔本系統稅務服裝的管理工作；組織落實地 方稅務系統內部審計工作制度，組織實施財務收支審計、領導幹部經濟責任審計和專項審計調查工作，指導、協調本系統的內部審計工作。
（11）信息處
負責組織落實稅收信息化建設規劃；負責建設、管理和維 護信息化基礎設施，負責稅收業務信息化應用系統的運行維護工作，負責網絡建設和安全工作，負責信息化培訓工作；承擔省局數據處理副中心的有關任務。
信息處下設綜合科、系統保障科、開發應用科、網絡安全科、政務信息科、數據采集科。
（12）機關黨委
負責機關和直屬單位的黨群工作；負責本系統宣傳教育工作、思想政治工作、精神文明建設和稅務文化建設；承擔機關思想政治工作、精神文明建設和統戰工作；承擔機關入黨積極分子的教育培訓考察工作及發展黨員工作；指導本系統黨群工作。
（13）監察室（與紀檢機構合署）
組織落實紀律檢查、行政監察工作制度，擬訂具體實施辦法；組織協調本系統的黨風廉政建設和反腐敗工作；受理對本系統工作人員違法違紀行為的檢舉、控告及有關申訴；查處本系統工作人員違法違紀案件及其他重要案件；開展執法監察和糾風工作。