（壹）稅負影響
從稅負角度分析，營改增對於小規模企業納稅人及壹般納稅人來說，作用較為明顯。營改增可有效降低小規模企業的稅負率，並增加了現代服務業的可抵扣稅額的數額和範圍，提高了運輸支出抵扣稅額比例。從行業的角度分析，營改增增加了交通運輸業的可抵扣稅負，將稅率從原來的3%提高至11%，但由於稅負波動幅度較小，在實際征收過程中，部分企業的稅負下降幅度不大。對於壹些非可抵扣類資產行業及勞務行業來說，稅負差異性較大，部分企業稅負並無下降，反呈上升趨勢。在進行稅制改革時，應全面考慮這部分企業的利益，合理調整稅率，或重新制定應稅金額，企業應當重視國家法規，針對問題申請財政補助，提高企業的利益，以免造成虧損。
（二）會計核算影響
營改增對企業會計核算的影響較大，營業稅征收時，並不存在銷項稅額以及進項稅額，相關收入只需按實際入賬即可，而成本按照實際支出為準。但實行營改增後，徹底改變了收入入賬方式和原則。例如服務行業，營業稅改增值稅後，收入入賬時，需按照稅率扣除銷項稅額，成本也需扣除進項稅額，且銷項稅額及進項稅額均采用“應交稅金”進項核算，當期應繳納的稅額相當於銷項稅額和進項稅額的總差額，在營業稅核算時，只需將收入額或收支額差直接乘以稅率即可算出稅收。因此，從會計核算的角度分析，營改增後，稅金、成本以及相關收入方面的核算方式發生巨大變化，企業財務管理也隨著核算方式的改變而改變。營改增試點企業與非試點企業的會計核算方式不壹致，由於營改增並未實行壹次性推廣，只在部分地區試點，因此，加大了部分跨地區經營企業的會計核算難度。這部分跨地區經營企業需進行不同稅種的調整，對不同的稅收方式進行銜接，企業會計的核算難度較大。營改增對於綜合經營企業來說，在企業會計核算方面的要求更高，如果在營改增過程中，如果綜合經營企業無法劃分出明確的經營業務性質，無法將各類業務的核算明細化，則按照高稅率稅種來進行企業的會計核算。目前，大多數服務行業屬於綜合經營企業，為降低中小企業的稅負，應針對不同稅種的業務，分別進行核算。
（三）發票管理影響
營改增對於發票的管理也造成了壹定的影響。例如，在征收營業稅時，服務類企業發票只需開具稅務發票，但實行營改增稅制後，由於分有銷項稅、進項稅，企業發票的管理更加規範更加嚴格。增值稅發票管理存在小規模納稅人及壹般納稅人之分，小規模納稅人所用的發票只有壹種，即普通發票，在發票管理方面，與營業稅發票管理相似。壹般納稅人的發票分為2種，即普通發票和專用發票，稅務部對於發票的使用也提出了明確規定。由於增值稅關系到稅收的抵扣，如發票使用不當將會造成企業的法律風險。增值發票的限額較低，與營業稅發票限額不壹樣，增值稅壹般納稅人的發票限額壹般為10萬元，與服務業務限額存在較大差距。申請高額發票時，所需時間長，不利於業務的開展。