對增值稅壹般納稅人進行納稅評估，稅負率是重要的評價指標，稅務機關和納稅人都需要分析企業的稅負率是否合理。實行金稅工程以後，稅務機關獲取行業平均數據比較容易，但如何把握不同企業之間的個體差異難度比較大。分析企業稅負率的合理性必須從企業的經營特征入手，生產相同產品的企業，由於生產經營方式不同，稅負率會有比較大的差異。具體分析可以從以下幾點著手：
1、分析企業的價值鏈
制造企業的價值鏈通過包括了研發設計、采購、生產制造、銷售、運輸、售後服務、行政人力資源等部分。對於壹個獨立的企業，往往內部囊括了以上價值鏈的全部，各個部分產生的增加值在同壹家公司匯集，企業稅負比較高。對於集團公司，內部價值鏈各個部分可能是分開的，因此，每家企業的增值稅稅負比較低。
2、分析企業的生產方式
企業的加工費用包括了折舊、人工、輔助生產的費用，這些費用都沒有對應的進項可以抵扣。但如果企業將部分產品發外加工，對方開具專用發票，這些加工費就產生了進項，企業銷售額相同的情況下，交納的增值稅減少，稅負下降。企業高速成長過程中，選擇發外加工模式的情況很普遍，所以分析稅負率時，要分析企業是否存在發外加工的情況。
3、分析企業的運輸方式
現在企業銷售產品往往是送貨到對方的倉庫，運輸成本比較高。運輸費用的處理有不同的方式，我們比較兩種常見方式的稅負差異：壹是買方承擔，運輸公司直接開具發票給買方；壹是賣方承擔，運輸公司直接開具發票給賣方。
4、分析企業產品的市場定位
現在分析稅負時比較強調同行業比較。其實，同壹行業的企業在市場中的定位往往不同。有些企業樹立品牌形象，走高端路線，產品品質好，銷售價格貴。有些產品重視低成本運作，重視大眾市場，市場容量大，贏在薄利多銷。由於市場地位不同，產品的毛利不壹樣，利潤是增值額的壹部分，利潤越高，稅負越高。因此同壹行業中，做高端產品的企業稅負比較高，做低端產品的企業稅負比較低。
5、分析企業的銷售策略
影響增值稅稅負的因素還包括企業的銷售策略。基本的營銷策略有兩種：壹種是推動式。方式的特點是給予經銷商大的折扣、優惠、返點、獎勵，靠經銷商來推動市場。另壹種是拉動式。方式特點是通過品牌運作、廣告投入、營銷活動使最終消費者對產品認同、產生好感，拉動市場，對經銷商沒有特別的獎勵和優惠。