土地使用稅以納稅人實際占用的土地面積為計稅依據。占用的土地已核發土地使用證的，按照土地使用證確認的面積征收；未核發土地使用證的，按實際占用土地面積或稅務機關核定的面積征收。用建築面積除以層數來計算土地使用稅計稅依據的方法，只是在納稅人不能準確提供土地面積的情況下的壹種簡單方法。
根據城鎮土地使用稅的有關規定，納稅人實際占用的土地面積，是指省、自治區、直轄市人民政府確定的土地面積。實際占用面積按以下方法確定:
(1)凡由省級人民政府組織確定面積的單位，以確定的土地面積為準；
(2)未組織調查，但納稅人持有政府頒發的土地使用證書的，以證書確認的土地面積為準；
(3)未核發土地使用證的，納稅人應如實申報土地面積。
法律依據
《國家稅務總局關於檢查簽發的通知》規定:“六。納稅人實際占用土地面積的確定。納稅人實際占用的土地面積，是指省、自治區、直轄市人民政府確定的土地面積。未組織調查，但納稅人持有政府部門核發的土地使用證書的，以證書確認的土地面積為準；未核發土地使用證的，納稅人應當如實申報土地面積。”