1、票面的區別，增值稅發票為可抵扣發票，有增值稅專用字樣，普通發票則有增值稅普通發票字樣。增值稅專用發票是三聯式的，增值稅普通發票是兩聯式的。
2、兩者作用也有區別，對於開票企業則沒有區別，不管是哪類票都要繳納銷項增值稅，但對於受票企業，只要增值專用發票才可以抵扣，增值稅普通發票則不可以。
3、開票範圍區別，對於開票企業，只有營業範圍內的銷售才可以開具增值稅專用發票。
4、開票資質區別，只有壹般納稅人才有資格開具增值稅專用發票，小規模企業則只能開具增值稅普通發票。
5、管理區別，不管是增值稅專用發票或增值稅普通發票，稅務管理上都是每月上報、購買查驗。
但對於企業的進項方面著重於審核具有可抵扣稅的增值稅專用發票。增值稅是以商品（含應稅勞務）在流轉過程中產生的增值額作為計稅依據而征收的壹種流轉稅。從計稅原理上說，增值稅是對商品生產、流通、勞務服務中多個環節的新增價值或商品的附加值征收的壹種流轉稅。實行價外稅，也就是由消費者負擔，有增值才征稅沒增值不征稅。
增值稅是對銷售貨物或者提供加工、修理修配勞務以及進口貨物的單位和個人就其實現的增值額征收的壹個稅種。增值稅已經成為中國最主要的稅種之壹，增值稅的收入占中國全部稅收的60%以上，是最大的稅種。
《中華人民***和國稅收征管法》第二十二條 增值稅專用發票由國務院稅務主管部門指定的企業印制；其他發票，按照國務院主管部門的規定，分別由省、自治區、直轄市國家稅務局、地方稅務局指定企業印制。未經前款規定的稅務機關指定，不得印制發票。