1960年9月，部領導決定將勘查院與勘查司下屬的機械設計室合並，組建地質部勘查技術研究設計院，鄭、白清培任副院長。勘探技術研究設計院成立後，黨的組織關系在地質部黨委。七
1966年6月，“文化大革命”運動開始，勘探院、設計院卷入那場十年轟轟烈烈的運動。混亂相繼出現，黨政工作癱瘓，科研工作中斷，勘探技術研究設計工作損失慘重。地質部在1966上半年決定將勘探院遷至周口店，同樣失敗。
1968年8月，解放軍陸軍宣傳隊和工宣隊壹起進駐設計院(1970年5月，設計院劃歸軍管)；9月，對地質科學院實施了戒嚴。1969 165438+10月，根據上級指示，在軍隊宣傳隊和工業宣傳隊的安排下，設計院大部分職工以“打、批、改”的形式到河北張家口康保縣農村進行再教育，直到5月1970。
1969勘查院革命委員會成立，鐘同誌任革命委員會副主任。4月，勘探所下放至江西省峽江縣水邊公社坑西生產隊地質部五七幹校。
1969 10，上級決定將勘查院的檔案、資料、圖書裝箱運輸至湖北省宜昌地質研究院地質礦產研究所保管。由於當時氣氛緊張，工期緊，倉促包裝托運，保管不當，造成了不可挽回的損失。
1970 2月19日，中國計劃委員會地質局以“(70)26號”文對地質科學院關於科研單位戰備和內部遷移問題的批復。文中寫得很清楚:“勘查院、地質院絕對年齡組遷到湖北宜昌；地質研究所(不含絕對年齡組)與礦床研究所合並，與力學研究所遷至陜西藍田。信息辦和醫院的搬遷要看藍田基建的進度。暫時留在北京的少量人員和設備也要在任務完成後酌情調整和搬遷。”
就在勘探院搬遷到宜昌的準備工作已經完成，整裝待發的時候，國家計委(71)地質局下發了31號文件，命令搬遷到陜西藍田縣薛佳村。同時，國家計委地質局軍代表接見了“五·七”期間在江西幹校的鄭同誌，指示他在陜西藍田縣村成立壹個以原勘探院和設計院人員為主的探礦工程研究所。
1973年4月，中國* * *勘查院黨委成立，鄭同誌任黨委書記，金兆來、閻新年同誌任黨委副書記。1975 10經渭南革委會與地質科學院協商，國家計委地質局批準鄭同誌為革委會主任，金兆來同誌、閻新年同誌為革委會副主任。
1974年5月後，由於遠離上級機關，無法在藍田站開展工作，科研決策困難。研究所的指揮中心逐漸有意無意地調回北京，大家都擠在地質科學院東專業館壹樓為數不多的辦公室裏進行勘探。此後，特別是9月1976之後，勘探試驗站成為勘探院指揮中心所在地。
1977 65438+2 21、地科院(77)183號文件《關於變更院及所屬科室主任職稱的通知》明確規定:“現地科院革命委員會主任、副主任及所屬科室(博物館)革命委員會主任、主任將從此“文革”的產物——革命委員會，在勘探院內消失，而
1978年4月22日，國家地質總局下發(1978)320號文，決定在勘查方法和手段上隸屬科研單位——勘查院(含周口店勘查試驗站)、物探院、原西南院七室、150工程組等。地質部勘察技術研究設計院的領導。此後，勘探院從地質院分離出來。
1980地質部根據“黨要善於領導科技工作，科技業務工作由主任和副主任分工負責”的精神，對勘查院領導班子進行了調整。地質部以(1980)681號文件，任命鄭為黨組書記(正局級)；任命王德茂、耿瑞倫、張、曾德鵬、鄒誌華為副主任(副主任級)。此次，王德茂、耿瑞倫、曾德鵬、鄒誌華四位具有實踐經驗和較高學術造詣的技術幹部被提拔到領導崗位，在探研院歷史上尚屬首次。
7月，1981，廊坊新址基建任務中的主體工程已完成，具備科研、工作、生活條件。
1984年6月，地質部探礦工程設備工業公司工機基(1984)14號文件批準建設綜合樓和實驗室，面積3900M2。壹期建設任務完成後，在100畝土地範圍內，建設科研、生產、生活兩大區域，總基礎設施面積29224M2。從那以後，科研、生產、生活的設施都相當大了。
1985年，地質礦產部決定將鉆探機械實驗室、選礦設備實驗室、試驗廠劃歸地質礦產部經濟研究中心(前身為地質部調查技術研究設計院)，從1985年8月31日起正式與勘查院分離。當年，地質礦產部批準勘查試驗站更名為“地質礦產部勘查工程研究所”。
1986年3月24日，國家科委發布了《科研單位分類暫行規定》。《規定》第二條指出:凡主要從事技術開發(包括試驗開發、設計試制、推廣示範、技術服務和小批量、單件常規生產)並能用於實際研究的單位，均為技術開發類型。據此，勘探院被指定為“技術開發單位”。
1990年8月22日，國家科委、財政部、國家稅務總局《關於技術開發型科研單位性質的通知》特別明確了技術開發型科研單位事業費核減後的性質。
1999年7月，中國地質科學院重組，研究所劃歸重組後的中國地質科學院領導。
2000年4月，研究所領導班子調整，甘興平任所長、黨委書記，張進場、劉三義任副所長。
2001 11根據《關於水利部等四部門所屬98家科研機構分類改革總體方案的批復》精神，地質科學院被正式確定為全國公益性科研機構分類改革首批啟動單位，我院是整體轉制為科技企業的5家單位之壹。