專精特新和小巨人區別是：概念不同、獎補不同、認定標準不同。
1、概念不同
專精特新是2013年7月工信部發布的，正式提出發展專精特新類中小企業，即促進中小企業走“專業化、精細化、特色化、新穎化”發展之路。專精特新小巨人是在專精特新範圍內，進壹步開展小巨人的認定。
2、獎補不同
專精特新和專精特新小巨人每戶給予壹次性的獎補雖然主要以各地方具體獎補金額為準，但是小巨人的要比專精特新的獎勵多壹些。
3、認定標準不同
專精特新是原則上註冊並經營兩年以上，具有獨立法人資格，符合國家中、小、微型企業劃分標準，擁有“專精特新”產品（技術）並生產經營狀況良好。
品（技術）符合國家標準，特殊行業的要符合國家相關規定，新產品（技術）須經過專門機構認定，有合法有效的註冊商標且進入市場（技術運用）壹年以上且符合國家產業政策、技術政策和相關行業政策。在市場、質量、效益或發展等方面處於同行業領先水平，具備先進性和示範性。
專精特新小巨人企業主導產品應優先聚焦制造業短板弱項，符合《工業“四基”發展目錄》所列重點領域，或符合制造強國戰略十大重點產業領域，或屬於產業鏈供應鏈關鍵環節及關鍵領域“補短板”“鍛長板”“填空白”產品，或圍繞重點產業鏈開展關鍵基礎技術和產品的產業化攻關，或屬於新壹代信息技術與實體經濟深度融合的創新產品。
專精特新小巨人的基本條件
1、在中華人民***和國境內工商註冊登記、連續經營3年以上、具有獨立法人資格、符合《中小企業劃型標準規定》的中小企業，且屬於省級中小企業主管部門認定或重點培育的專精特新中小企業或其他創新能力強、市場競爭優勢突出的中小企業。
2、堅持專業化發展戰略，長期專註並深耕於產業鏈某壹環節或某壹產品，能為大企業、大項目提供關鍵零部件、元器件和配套產品，或直接面向市場並具有競爭優勢的自有品牌產品。
3、具有持續創新能力和研發投入，具有壹定的示範推廣價值。
4、重視並實施長期發展戰略，具備發展成為相關領域國際知名企業的潛力。
以上內容參考百度百科-專精特新“小巨人”企業認定與培育辦法